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wushirao

木虫 (正式写手)

[求助] checkcif中B、C类错误求助 已有3人参与

Crystal system given = triclinic
Short Inter D-H..H-D H4WA .. H3WA .. 1.88 Ang
D-H Without Acceptor O3W - H3WB ... Please Check
D-H Without Acceptor O5W - H5WA ... Please Check
D-H Without Acceptor O5W - H5WB ... Please Check
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of . 124 Ang3
C类错误
_diffrn_measured_fraction_theta_full Low ....... 0.978 Note
Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check
Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check
Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check
Ratio of Maximum / Minimum Residual Density .... 2.60 Why ?
Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0153 Ang.
Short Inter D-H..H-D H1WB .. H4WB .. 2.10 Ang.
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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
Short Inter D-H..H-D H4WA .. H3WA .. 1.88 Ang
D-H Without Acceptor O3W - H3WB ... Please Check
D-H Without Acceptor O5W - H5WA ... Please Check
D-H Without Acceptor O5W - H5WB ... Please Check
以上因为加氢不对,删除了重新加,envi看O原子的环境,寻找合适角度和键长的Q峰指认为氢,
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of . 124 Ang3
有未知的溶剂分子你没有指认,重新解一下
C类错误基本没事,可以忽略
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
2楼2014-05-15 14:24:47
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lijiawork

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wushirao: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-05-16 08:48:24
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS
说明你溶剂没找全,可以试着再找一下,实在不行就在platon中用squeeze处理带掉。
Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check
Medium Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check
Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ... Please Check
这是要输入晶体的尺寸,按从小到大顺序输几个值就行。
Ratio of Maximum / Minimum Residual Density .... 2.60 Why ?
这个我觉得跟你溶剂分子没完全找出来有关系,溶剂找全了或者squeeze掉了,这个问题就好解决了。
Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0153 Ang.
试下把温度因子高的碳原子用simu,delu 限制下

以上这几个情况遇见过,希望写出来对你有帮助。
3楼2014-05-16 06:47:18
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wushirao: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-05-16 08:48:33
上边两位说的已经很详细了,但是忽略了一点,就是你的数据完整度略低,可以加omit命令提高一下。
4楼2014-05-16 08:10:20
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