| 查看: 2082 | 回复: 12 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
wungung金虫 (初入文坛)
|
[求助]
GMX动力学一直跑不起来，急求帮助！ 已有1人参与
|
|
|
各位师兄师姐，急求Gromacs跑动力学的帮助！ 我跑的是双层脂质分子膜，已经进行了能量最小化，并且Fmax已经降到了100以内。 之后跑长程动力学一直提示这个错误，并且降低步长、核数仍然无法解决。 尝试跑位置限制动力学，把脂质的位置固定，也出现同样的错误。 不知这个该如何解决啊！求各位师兄师姐帮忙解决一下。非常感谢！  newscreen1495395460.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
不自信的我
已经有8人回复
-
磺酰氟产物，毕不了业了！
已经有8人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有10人回复
-
26申博（荧光探针方向，有机合成）
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有3人回复
-
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有26人回复
-
2026年机械制造与材料应用国际会议 （ICMMMA 2026）
已经有4人回复
-
Cas 72-43-5需要30g，定制合成，能接单的留言
已经有8人回复
-
北京211副教授，35岁，想重新出发，去国外做博后，怎么样？
已经有8人回复
-
自荐读博
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- amber跑动力学，晶体结构中的水能不能用限制力固定住
已经有8人回复
- 最近在学习分子动力学模拟，不知道castep跑分子动力学效果如何呢？
已经有12人回复
wungung
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2010.4
- 帖子: 37
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 2662155
- 注册: 2013-09-17
- 性别: MM
- 专业: 中药学其他科学问题
4楼2014-10-14 22:04:42
angjzy
木虫 (小有名气)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1745.2
- 散金: 1491
- 红花: 5
- 帖子: 251
- 在线: 172.3小时
- 虫号: 647898
- 注册: 2008-11-06
- 专业: 药物材料
2楼2014-10-14 21:58:19
wungung
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2010.4
- 帖子: 37
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 2662155
- 注册: 2013-09-17
- 性别: MM
- 专业: 中药学其他科学问题
3楼2014-10-14 22:03:17
angjzy
木虫 (小有名气)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1745.2
- 散金: 1491
- 红花: 5
- 帖子: 251
- 在线: 172.3小时
- 虫号: 647898
- 注册: 2008-11-06
- 专业: 药物材料
|
如果你设置的总核数就是4个，那么应该没有问题，就是没有分给PME计算的核 那就还是系统没有最小化好 对照下面链接，检查错误 http://www.gromacs.org/Documenta ... _their_charge_group |
5楼2014-10-14 22:42:49