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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 建立超晶胞后空间群改变
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841761558

金虫 (小有名气)

[求助] 建立超晶胞后空间群改变已有1人参与

急！做掺杂，建立超晶胞后空间群发生变化，需要Rebuild crystals改为建立超胞前的空间群吗？如果不改的话，掺杂后原子的分数坐标就是这个超胞里的坐标，对后续能带的计算没有影响吗？
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一切都好！
1楼2014-10-14 14:06:57
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
掺杂之后单晶胞的空间群变了吗？如果没有改变的话，超晶胞应该不变才对。请详细讲一下你的掺杂步骤。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-10-14 14:50:49
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841761558

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-10-14 14:50:49
掺杂之后单晶胞的空间群变了吗？如果没有改变的话，超晶胞应该不变才对。请详细讲一下你的掺杂步骤。

非常感谢你！原晶胞的空间群是R3-MH,先在MS里做出这个晶胞，然后Build-Symmetry-supercell，设置超晶胞的大小，比如是2*2*2,设置完之后发现空间群已经变了，这时还没做替代掺杂。
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一切都好！
3楼2014-10-14 15:16:22
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
841761558: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-10-15 08:27:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by 841761558 at 2014-10-14 15:16:22
非常感谢你！原晶胞的空间群是R3-MH,先在MS里做出这个晶胞，然后Build-Symmetry-supercell，设置超晶胞的大小，比如是2*2*2,设置完之后发现空间群已经变了，这时还没做替代掺杂。...

如果你确定原胞没问题的话，做出来的超胞看起来应该是几个原胞的叠加，如果确实如此，就不必管了吧。
按我的理解，超胞只是几个原胞的简单周期性叠加，应该不会变空间群才对，也许我的了解不够吧。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2014-10-14 16:48:39
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841761558

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-10-14 16:48:39
如果你确定原胞没问题的话，做出来的超胞看起来应该是几个原胞的叠加，如果确实如此，就不必管了吧。
按我的理解，超胞只是几个原胞的简单周期性叠加，应该不会变空间群才对，也许我的了解不够吧。...

假如建立超晶胞后不管空间群，我在考虑另外一个问题。1.超胞里面是可以同时替换几个不同位置的原子还是说只能替换一个？我觉得是可以替换好几个，但这样的话就会有很多种可能性。2.替换这个位点的原子时是必须100%替换还是说可以设置不同比例的？看数据库那个坐标，应该是可以设置不同比例，也就是同一个位置可以有两个元素。
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一切都好！
5楼2014-10-15 08:28:27
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
5楼: Originally posted by 841761558 at 2014-10-15 08:28:27
假如建立超晶胞后不管空间群，我在考虑另外一个问题。1.超胞里面是可以同时替换几个不同位置的原子还是说只能替换一个？我觉得是可以替换好几个，但这样的话就会有很多种可能性。2.替换这个位点的原子时是必须100% ...

替换原子数根据你需要的掺杂比例修改

你看到的某位置SOF不为1是修改property里的IsMixtureAtom
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2014-10-15 10:50:15
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841761558

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by pigrass at 2014-10-15 10:50:15
替换原子数根据你需要的掺杂比例修改

你看到的某位置SOF不为1是修改property里的IsMixtureAtom...

是的，我是选中要被替代掺杂的那个原子，左侧property栏改这个原子的occupancy，改之前是100%，把这个改为50%，然后点Add atom，加上要掺杂的原子，occupancy设置为50%，这样可以吗？望指教，谢谢。
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一切都好！
7楼2014-10-16 08:30:02
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
7楼: Originally posted by 841761558 at 2014-10-16 08:30:02
是的，我是选中要被替代掺杂的那个原子，左侧property栏改这个原子的occupancy，改之前是100%，把这个改为50%，然后点Add atom，加上要掺杂的原子，occupancy设置为50%，这样可以吗？望指教，谢谢。...

你可以试试 大不了跳出来间距太小的提示
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
8楼2014-10-16 10:03:09
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金玉亮1

禁虫
本帖内容被屏蔽
9楼2021-12-07 22:14:51
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