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汕头大学海洋科学接受调剂
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xiaoxiao45

至尊木虫 (正式写手)

[求助] berkeleygw 输入文件问题 已有1人参与

有哪位大神指导一下berkeleygw中的WFN.in文件lattice vector怎么计算的吗?为什么kgrid.x运行后bravais lattice和crystal 的space group总是对不上?谢谢了

另外知道晶体的point group: R3c
a=b=c= 5.667
alfa=beta=gama=59.17
原子坐标 1 Bi,2 Fe,3 O
1  0.00000000  0.00000000  0.00000000
1  0.50000000  0.50000000  0.50000000
2  0.22120000  0.22120000  0.22120000
2  0.72120000  0.72120000  0.72120000
3  0.53500000  0.94000000  0.39400000
3  0.94000000  0.39400000  0.53500000
3  0.03500000  0.89400000  0.44000000
3  0.39400000  0.53500000  0.94000000
3  0.89400000  0.44000000  0.03500000
3  0.44000000  0.03500000  0.89400000
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xiaoxiao45

至尊木虫 (正式写手)

请问能不能给个详细的计算步骤,万分感谢,可以加送金币

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2014-10-05 23:17:38
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查看全部 15 个回答

liqizuiyang

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:36:30
1. kgrid.x中的基矢坐标和原子坐标均为在同一坐标系下的直角坐标,而不是分数坐标;
2. 如果是简单晶格,布拉伐格子对称性和晶体对称性才能对上号;复式晶格一般对不上。
2楼2014-10-05 16:34:00
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liqizuiyang

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+5, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-06 23:36:41
如果用QE算DFT部分,有个简便方法。

先进行scf计算,输出文件中这一部分就是基矢坐标:
     crystal axes: (cart. coord. in units of alat)
               a(1) = (   4.582581   4.582581   0.000000 )  
               a(2) = (   0.000000   4.582581   4.582581 )  
               a(3) = (   4.582581   0.000000   4.582581 )  

这一部分就是同一坐标系下的原子坐标:
   Cartesian axes

     site n.     atom                  positions (alat units)
         1           O   tau(   1) = (   2.3756976   2.2068836   2.3756976  )
         2           O   tau(   2) = (   4.6669876   4.4981749   2.3756989  )
         3           O   tau(   3) = (   2.3756989   4.4981749   4.6669876  )
         4           O   tau(   4) = (   4.6669876   6.7894636   4.6669876  )
         5           O   tau(   5) = (   4.4981749   2.3756989   4.4981749  )
         6           O   tau(   6) = (   6.7894636   4.6669876   4.4981749  )
         7           O   tau(   7) = (   4.4981749   4.6669876   6.7894636  )
         8           O   tau(   8) = (   6.7894648   6.9582788   6.7894648  )
         9           Mg  tau(   9) = (   2.2912906   0.0000000   2.2912906  )
        10           Mg  tau(  10) = (   4.5825812   2.2912906   2.2912906  )
        11           Mg  tau(  11) = (   2.2912906   2.2912906   4.5825812  )
        12           Mg  tau(  12) = (   4.5825812   4.5825812   4.5825812  )
        13           Ca  tau(  13) = (   0.0000000   0.0000000   0.0000000  )
        14           Ca  tau(  14) = (   2.2912906   2.2912906   0.0000000  )
        15           Ca  tau(  15) = (   0.0000000   2.2912906   2.2912906  )
        16           Ca  tau(  16) = (   2.2912906   4.5825812   2.2912906  )
4楼2014-10-06 10:00:31
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xiaoxiao45

至尊木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liqizuiyang at 2014-10-06 10:00:31
如果用QE算DFT部分,有个简便方法。

先进行scf计算,输出文件中这一部分就是基矢坐标:
     crystal axes: (cart. coord. in units of alat)
               a(1) = (   4.582581   4.582581   0.000000 )  
...

你好,感觉还是不行,我把scf的输入文件给你看看,看看是不是哪出问题了
&control
   prefix = 'BFO'
   calculation = 'scf'
   restart_mode = 'from_scratch'
   wf_collect = .false.
   tstress = .true.
   tprnfor = .true.
   outdir = './'
   wfcdir = './'
   pseudo_dir = './'
/
&system
   ibrav = 5
   celldm(1) = 10.71
   celldm(4) = 0.5125
   nat = 10
   ntyp = 3
   nbnd = 55
   ecutwfc = 140.0
/
&electrons
   electron_maxstep = 100
   conv_thr = 1.0d-10
   mixing_mode = 'plain'
   mixing_beta = 0.7
   mixing_ndim = 8
   diagonalization = 'david'
   diago_david_ndim = 4
   diago_full_acc = .true.
/
ATOMIC_SPECIES
  Bi  208.98  Bi.UPF
  Fe  55.845  Fe.UPF
  O  15.999  O.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
Bi  0.00000000  0.00000000  0.00000000
Bi  0.50000000  0.50000000  0.50000000
Fe  0.22120000  0.22120000  0.22120000
Fe  0.72120000  0.72120000  0.72120000
O  0.53500000  0.94000000  0.39400000
O  0.94000000  0.39400000  0.53500000
O  0.03500000  0.89400000  0.44000000
O  0.39400000  0.53500000  0.94000000
O  0.89400000  0.44000000  0.03500000
O  0.44000000  0.03500000  0.89400000
K_POINTS automatic
5 5 5 1 1 1
5楼2014-10-06 10:34:25
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