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TeddyUSCT

银虫 (初入文坛)

[求助] 输入文件有什么错误

输入文件如下：
%mem=1GB
%nproc=8
# oniom(b3lyp/genecp:hf/3-21g) opt

CSD ENTRY OKEMUM

0 1 0 1 0 1
Rh               0   -9.53100000   -2.22800000   -3.89700000 H
Cl               0  -10.21100000   -3.89800000   -5.49500000 H
O                0  -10.11200000   -3.51200000   -2.41400000 H
N                0  -11.49500000   -1.55700000   -4.07900000 H
C                0   -8.19800000   -0.88100000   -2.85100000 H
C                0   -7.54700000   -2.08900000   -3.08900000 H
C                0   -7.43400000   -2.33400000   -4.38000000 H
C                0   -8.02800000   -1.29800000   -5.09600000 H
C                0   -8.50700000   -0.35800000   -4.12000000 H
C                0  -11.31300000   -3.68100000   -1.95000000 H
C                0  -11.46700000   -4.62700000   -0.89200000 L H 10
C                0  -12.72100000   -4.92900000   -0.41700000 L
C                0  -13.81800000   -4.31800000   -0.87700000 L
C                0  -13.72000000   -3.38100000   -1.86200000 L H 15
C                0  -12.46700000   -3.05600000   -2.40000000 H
C                0  -12.47700000   -2.04700000   -3.43600000 H
C                0  -11.69300000   -0.50100000   -5.05900000 L H 4
C                0  -12.99500000   -0.61100000   -5.83900000 L
C                0  -11.56600000    0.89500000   -4.46200000 L
C                0  -11.90000000    1.16700000   -3.14500000 L
C                0  -11.77800000    2.44200000   -2.66800000 L
C                0  -11.32500000    3.46500000   -3.45200000 L
C                0  -11.01100000    3.19400000   -4.75000000 L
C                0  -11.10900000    1.92100000   -5.22800000 L
H                0   -8.39000000   -0.50000000   -2.02500000 L H 5
H                0   -7.23000000   -2.65300000   -2.42100000 L H 6
H                0   -7.02300000   -3.08000000   -4.75300000 L H 7
H                0   -8.10100000   -1.22900000   -6.02100000 L H 8
H                0   -8.93800000    0.44700000   -4.29500000 L H 9
H                0  -10.71800000   -5.03900000   -0.52600000 L
H                0  -12.80800000   -5.57700000    0.24500000 L
H                0  -14.65200000   -4.53400000   -0.52300000 L
H                0  -14.48600000   -2.95700000   -2.17800000 L
H                0  -13.31300000   -1.70900000   -3.66300000 L H 16
H                0  -10.96900000   -0.58900000   -5.71500000 L
H                0  -13.01400000   -1.44600000   -6.31300000 L
H                0  -13.73700000   -0.57100000   -5.23000000 L
H                0  -13.05700000    0.11400000   -6.46500000 L
H                0  -12.20600000    0.48700000   -2.58900000 L
H                0  -12.00800000    2.61900000   -1.78400000 L
H                0  -11.23500000    4.32500000   -3.10900000 L
H                0  -10.72700000    3.87900000   -5.31200000 L
H                0  -10.85700000    1.74900000   -6.10600000 L

C H O N Cl 0
6-31g
****
Rh 0
LANL2TZ(f)
****

Rh 0
LANL2TZ(f)


高斯计算总是出错，下面是输出文件最后部分：
***** Axes restored to original set *****
Cartesian Forces:  Max      .160294325 RMS      .078407258
SvSCFP is copying densities from files   528 and   530 to   603.
ONIOM: saving gridpoint  3
ONIOM: restoring gridpoint 17
ONIOM: generating point  2 -- high level on model system.
General basis read from cards:  (5D, 7F)
  QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE.
LANL2TZ(f)
'
Last state="Top"
TCursr=  746 LCursr=    0
Error reading general basis specification.
Error termination via Lnk1e in /gpfs1/chem/tangshiy/G03/g03/l301.exe at Sun May 26 14:06:09 2013.
Job cpu time:  0 days  0 hours  6 minutes 38.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     78 Int=      0 D2E=      0 Chk=     10 Scr=      1
我刚接触高斯，看不懂是什么错误，还望有高人指点，很急，谢谢。
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1楼 2013-05-27 17:16:38
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springxa

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这应该是g09不包含lanl2tz基组的原因，需要手动输入。
你可以去https://bse.pnl.gov/bse/portal找到你需要的基组复制到输入文件即可。
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2楼2013-05-27 19:29:48
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springxa

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

我顺便看了下，应该是这个：
****
Rh     0
S   1   1.00
      2.6460000              1.0000000        
S   1   1.00
      1.7510000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.5713000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.1438000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.0428000              1.0000000        
P   1   1.00
      5.4400000              1.0000000        
P   1   1.00
      1.3290000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.4845000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.0869000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.0257000              1.0000000        
D   2   1.00
      3.6690000              0.0760059        
      1.4230000              0.5158852        
D   1   1.00
      0.5091000              1.0000000        
D   1   1.00
      0.1610000              1.0000000        
F   1   1.00
      1.3500000              1.0000000        
****

RH     0
RH-ECP     3     28
f-ul potential
  5
0    600.3243032             -0.0538958        
1    157.6910176            -20.1316282        
2     49.8841995           -105.3654121        
2     15.5966895            -42.3274370        
2      5.5099296             -3.6654043        
s-ul potential
  5
0     59.3442526              2.9753728        
1     83.7426061             25.1230306        
2     18.4530248            626.0926145        
2     12.4194606           -812.2549385        
2      8.8172913            467.3729340        
p-ul potential
  5
0     53.4309068              4.9537213        
1     65.6671843             20.4871116        
2     16.8369862            598.0120139        
2     11.3042136           -718.4059028        
2      8.0312444            382.8173151        
d-ul potential
  4
0     64.3993653              3.0279532        
1     43.4625053             24.7526516        
2     19.4020301            142.6844289        
2      4.6879328             32.1406857
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3楼2013-05-27 19:32:52
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TeddyUSCT

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by springxa at 2013-05-27 19:32:52
我顺便看了下，应该是这个：
****
Rh     0
S   1   1.00
      2.6460000              1.0000000        
S   1   1.00
      1.7510000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.5713000  ...

我后来又加了上面的东西，还是不对啊，是怎么个输入方法？

%mem=1GB
%nproc=8
# oniom(b3lyp/genecp:hf/3-21g) opt

CSD ENTRY OKEMUM

0 1 0 1 0 1
Rh               0   -9.53100000   -2.22800000   -3.89700000 H
Cl               0  -10.21100000   -3.89800000   -5.49500000 H
O                0  -10.11200000   -3.51200000   -2.41400000 H
N                0  -11.49500000   -1.55700000   -4.07900000 H
C                0   -8.19800000   -0.88100000   -2.85100000 H
C                0   -7.54700000   -2.08900000   -3.08900000 H
C                0   -7.43400000   -2.33400000   -4.38000000 H
C                0   -8.02800000   -1.29800000   -5.09600000 H
C                0   -8.50700000   -0.35800000   -4.12000000 H
C                0  -11.31300000   -3.68100000   -1.95000000 H
C                0  -11.46700000   -4.62700000   -0.89200000 L H 10
C                0  -12.72100000   -4.92900000   -0.41700000 L
C                0  -13.81800000   -4.31800000   -0.87700000 L
C                0  -13.72000000   -3.38100000   -1.86200000 L H 15
C                0  -12.46700000   -3.05600000   -2.40000000 H
C                0  -12.47700000   -2.04700000   -3.43600000 H
C                0  -11.69300000   -0.50100000   -5.05900000 L H 4
C                0  -12.99500000   -0.61100000   -5.83900000 L
C                0  -11.56600000    0.89500000   -4.46200000 L
C                0  -11.90000000    1.16700000   -3.14500000 L
C                0  -11.77800000    2.44200000   -2.66800000 L
C                0  -11.32500000    3.46500000   -3.45200000 L
C                0  -11.01100000    3.19400000   -4.75000000 L
C                0  -11.10900000    1.92100000   -5.22800000 L
H                0   -8.39000000   -0.50000000   -2.02500000 L H 5
H                0   -7.23000000   -2.65300000   -2.42100000 L H 6
H                0   -7.02300000   -3.08000000   -4.75300000 L H 7
H                0   -8.10100000   -1.22900000   -6.02100000 L H 8
H                0   -8.93800000    0.44700000   -4.29500000 L H 9
H                0  -10.71800000   -5.03900000   -0.52600000 L
H                0  -12.80800000   -5.57700000    0.24500000 L
H                0  -14.65200000   -4.53400000   -0.52300000 L
H                0  -14.48600000   -2.95700000   -2.17800000 L
H                0  -13.31300000   -1.70900000   -3.66300000 L H 16
H                0  -10.96900000   -0.58900000   -5.71500000 L
H                0  -13.01400000   -1.44600000   -6.31300000 L
H                0  -13.73700000   -0.57100000   -5.23000000 L
H                0  -13.05700000    0.11400000   -6.46500000 L
H                0  -12.20600000    0.48700000   -2.58900000 L
H                0  -12.00800000    2.61900000   -1.78400000 L
H                0  -11.23500000    4.32500000   -3.10900000 L
H                0  -10.72700000    3.87900000   -5.31200000 L
H                0  -10.85700000    1.74900000   -6.10600000 L

C H O N Cl 0
6-31g
****
Rh 0
LANL2TZ(f)
****

****
Rh     0
S   1   1.00
      2.6460000              1.0000000        
S   1   1.00
      1.7510000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.5713000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.1438000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.0428000              1.0000000        
P   1   1.00
      5.4400000              1.0000000        
P   1   1.00
      1.3290000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.4845000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.0869000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.0257000              1.0000000        
D   2   1.00
      3.6690000              0.0760059        
      1.4230000              0.5158852        
D   1   1.00
      0.5091000              1.0000000        
D   1   1.00
      0.1610000              1.0000000        
F   1   1.00
      1.3500000              1.0000000        
****

RH     0
RH-ECP     3     28
f-ul potential
  5
0    600.3243032             -0.0538958        
1    157.6910176            -20.1316282        
2     49.8841995           -105.3654121        
2     15.5966895            -42.3274370        
2      5.5099296             -3.6654043        
s-ul potential
  5
0     59.3442526              2.9753728        
1     83.7426061             25.1230306        
2     18.4530248            626.0926145        
2     12.4194606           -812.2549385        
2      8.8172913            467.3729340        
p-ul potential
  5
0     53.4309068              4.9537213        
1     65.6671843             20.4871116        
2     16.8369862            598.0120139        
2     11.3042136           -718.4059028        
2      8.0312444            382.8173151        
d-ul potential
  4
0     64.3993653              3.0279532        
1     43.4625053             24.7526516        
2     19.4020301            142.6844289        
2      4.6879328             32.1406857

这样对么，输出文件还是Error reading general basis specification.
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4楼2013-05-28 12:37:59
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springxa

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

你那个lanl2tz还在啊，正确的应该这样：

......
前面省略了

C H O N Cl 0
6-31g
****
Rh     0
S   1   1.00
      2.6460000              1.0000000        
S   1   1.00
      1.7510000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.5713000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.1438000              1.0000000        
S   1   1.00
      0.0428000              1.0000000        
P   1   1.00
      5.4400000              1.0000000        
P   1   1.00
      1.3290000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.4845000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.0869000              1.0000000        
P   1   1.00
      0.0257000              1.0000000        
D   2   1.00
      3.6690000              0.0760059        
      1.4230000              0.5158852        
D   1   1.00
      0.5091000              1.0000000        
D   1   1.00
      0.1610000              1.0000000        
F   1   1.00
      1.3500000              1.0000000        
****

RH     0
RH-ECP     3     28
f-ul potential
  5
0    600.3243032             -0.0538958        
1    157.6910176            -20.1316282        
2     49.8841995           -105.3654121        
2     15.5966895            -42.3274370        
2      5.5099296             -3.6654043        
s-ul potential
  5
0     59.3442526              2.9753728        
1     83.7426061             25.1230306        
2     18.4530248            626.0926145        
2     12.4194606           -812.2549385        
2      8.8172913            467.3729340        
p-ul potential
  5
0     53.4309068              4.9537213        
1     65.6671843             20.4871116        
2     16.8369862            598.0120139        
2     11.3042136           -718.4059028        
2      8.0312444            382.8173151        
d-ul potential
  4
0     64.3993653              3.0279532        
1     43.4625053             24.7526516        
2     19.4020301            142.6844289        
2      4.6879328             32.1406857
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5楼2013-05-28 13:10:16
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ZZU2011

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼主的机组写的不对，重新写一下
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6楼2013-05-28 17:52:09
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19870617

木虫 (著名写手)
收藏了！
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7楼2015-01-28 11:06:45
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小范范1989

木虫 (著名写手)
五楼回复的很好，你这个需要自定义机组，
关于自己定义机组的方法和详细的介绍，你需要看看sob的一个帖子，里面介绍了各种机组的定义方式，和有其他的几组，是一个很好学习的资料。至于具体的网址，我忘了，我在外面，我没法回去，你搜一搜。sob的自定义机组
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
8楼2015-01-29 13:24:09
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无际君清

新虫 (小有名气)
您好，您的这个问题解决了吗？
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9楼2019-12-04 09:30:40
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