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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] MS Forcite模块结构优化出错

在MS 5.5的Forcite模块做几何优化时,提示:
6 bond stretch(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.
9 inversion(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.
并且构型也很诡异,这6个键上连的原子都跑出去了,如图1所示。

我的模型是一个真空的盒子,里面有一个带负电(羧基)的有机物,加了Na离子来中和电荷。
已经分配力场和电荷,分配好了以后查看,发现羧基上O的电荷都是零,于是我自己这两个O一个设置零另一个设置为负一并且调了键序,确保整体是电中性。

MS Forcite模块结构优化出错
1.png
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

求高手指教
2楼2014-09-26 22:52:24
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