24小时热门版块排行榜    

查看: 3143  |  回复: 9

ytduh

金虫 (正式写手)

[求助] 结构优化的结果竟然重复不出来,每次优化后的结构都不一样,求高手解答……

先后使用forcite和DMOL3模块对一个含有长侧链的聚合物进行优化,每次运行结果中的分子结构直接就能看出侧链与主链平面的角度有很大差别……每次优化的参数都是一样的,求高手指点……
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

TOMA'S INDEX

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

安德

铁杆木虫 (著名写手)

** *_** ___ ***_ * _*

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-20 11:26:15
每次的初始构型是相同的吗?
That'sit! Justdoit!
2楼2012-04-20 08:55:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ytduh

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 安德 at 2012-04-20 08:55:46:
每次的初始构型是相同的吗?

是啊,就是先画出聚合物结构,添加上氢原子之后,点击clean使结构合理,然后依次进行forcite和DMOL3优化
3楼2012-04-20 09:05:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

安德

铁杆木虫 (著名写手)

** *_** ___ ***_ * _*

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-04-20 11:26:02
这二者优化的原理可是不一样的啊,前者是基于分子力学,后者是量子力学,不一样很正常,常理来讲后者的更精确。
不知道你为什么会先后分别用Forcite和DMol来优化,这样的目的何在?
That'sit! Justdoit!
4楼2012-04-20 10:44:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiuhui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ytduh: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-21 10:03:57
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-23 14:47:30
这二者优化的原理不一样,前者是基于分子力学,是宏观概念,后者是量子力学,是基于电荷,轨道等微观方面来优化的,后者更为准确,但前提是初始构型建的合理。我一般都是在Gassian里面优化好再导入MS。
5楼2012-04-20 17:37:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-04-23 11:26:29
不同模块的优化方法不一样,得到的结果当然不一样了。建议使用统一模块进行处理
自强不息
6楼2012-04-23 10:29:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwb168

银虫 (小有名气)

很正常
7楼2012-05-04 10:32:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyue1610

木虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by xiuhui at 2012-04-20 17:37:37
这二者优化的原理不一样,前者是基于分子力学,是宏观概念,后者是量子力学,是基于电荷,轨道等微观方面来优化的,后者更为准确,但前提是初始构型建的合理。我一般都是在Gassian里面优化好再导入MS。

是如何导入的?
8楼2012-07-09 17:16:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiuhui

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xiaoyue1610 at 2012-07-09 17:16:53
是如何导入的?...

高斯里面的输出构型存为mol格式就可以导入了,因为MS是可以读取mol的
9楼2012-07-09 19:37:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyue1610

木虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by xiuhui at 2012-07-09 19:37:45
高斯里面的输出构型存为mol格式就可以导入了,因为MS是可以读取mol的...

谢谢了哈!
10楼2012-07-10 10:05:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ytduh 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +3 pin8023 2026-02-28 5/250 2026-03-02 00:24 by 花YOU重开日
[考研] 材料复试调剂 +3 学材料的点 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:07 by ccp273206157
[考研] 求调剂 +5 yunziaaaaa 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:57 by ccp273206157
[考研] 材料学硕318求调剂 +11 February_Feb 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:53 by ccp273206157
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分,求调剂 +5 wsl111 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:45 by 暮雨星晴
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:31 by L135790
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 材料类求调剂 +10 wana_kiko 2026-02-28 12/600 2026-03-01 22:10 by 海嵙Y
[考研] 0856求调剂285 +10 吕仔龙 2026-02-28 10/500 2026-03-01 21:37 by 公瑾逍遥
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +5 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:47 by 无际的草原
[考研] 295求调剂 +7 19171856320 2026-02-28 7/350 2026-03-01 18:54 by 18137688336
[基金申请] 刚录用,没有期刊号,但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +3 gaoxiaoniuma 2026-02-28 4/200 2026-03-01 14:30 by jjj三跨
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 材料调剂 +4 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 4/200 2026-03-01 00:38 by 猫猫球alter
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
请填处理意见