应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 已知一个新基因的CDS，如何利用软件预测其结构，从而推测其表达的蛋白的类型、功能
51/1返回列表
查看: 3715  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hlxxym

木虫 (小有名气)

[求助] 已知一个新基因的CDS，如何利用软件预测其结构，从而推测其表达的蛋白的类型、功能 已有3人参与

请教一下各位

如果我对一个功能未知的基因（新基因）感兴趣，我只知道他的CDS，将核酸序列翻译成氨基酸序列以后，如何用软件预测它的蛋白质结构从而推测它的功能或者蛋白类型（比如酶、膜蛋白、受体）呢？能否列举一下流程，并针对每个流程推荐一下软件？

非常感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-09-17 10:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hlxxym

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by keke226 at 2014-09-18 21:29:40
蛋白结构和功能的预测可以用EXPASY网站在线的一些工具，比如SMART可以根据序列预测三级结构域。另外，Pfam网站也可以预测三级结构，还可以用于三级结构比对来推测功能。
...

非常感谢你的回复。我试过用EXPASY的swissmodel进行三维结构预测和比对，相似度大概都在40%左右。请问一般而言，相似度达到多少可以认为有参考价值？
赞一下 回复此楼
5楼2014-09-19 10:01:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

generalel

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hlxxym: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-19 10:02:10
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-10-14 02:29:49
推荐篇文章，自己看一下吧，里面有分析需要使用的各类软件。张丽娟，新基因功能预测的理论及方法，医学分子生物学杂志，2006.
赞一下 回复此楼
3楼2014-09-18 20:18:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keke226

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hlxxym: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-19 10:02:29
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-10-14 02:29:55
蛋白结构和功能的预测可以用EXPASY网站在线的一些工具，比如SMART可以根据序列预测三级结构域。另外，Pfam网站也可以预测三级结构，还可以用于三级结构比对来推测功能。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
读书廿年倦写字，如今翻书不识志，若知眷书悔前程，无如渔樵未识时。三年担柴熟山性，三年苦网谙水汹，前程在心自倦舒，识志何用书中清。
4楼2014-09-18 21:29:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hlxxym

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by generalel at 2014-09-18 20:18:22
推荐篇文章，自己看一下吧，里面有分析需要使用的各类软件。张丽娟，新基因功能预测的理论及方法，医学分子生物学杂志，2006.

非常感谢
回复此楼
6楼2014-09-19 10:01:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +5 yunziaaaaa 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:57 by ccp273206157
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:31 by L135790
[考研] 0854复试调剂 276 +3 wmm9 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:13 by 热情沙漠
[考研] 0856调剂 +5 刘梦微 2026-02-28 5/250 2026-03-01 22:30 by wang_dand
[考研] 材料类求调剂 +10 wana_kiko 2026-02-28 12/600 2026-03-01 22:10 by 海嵙Y
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +5 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:47 by 无际的草原
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 290求调剂 +9 材料专硕调剂； 2026-02-28 11/550 2026-03-01 17:21 by sunny81
[考研] 化工专硕342，一志愿大连理工大学，求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[基金申请] 刚录用，没有期刊号，但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料调剂 +4 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 4/200 2026-03-01 00:38 by 猫猫球alter
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭