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wardwaads

银虫 (小有名气)

[求助] 克隆出现的奇怪现象

最近在做DGGE条带的克隆,遇到奇怪的问题:
选用968f(黄色)和1401r(红色)作为引物进行dgge,然后割胶回收克隆,克隆测序结果如图,出现序列中前后引物交错的现象,无法找到目的序列。
用M13引物进行电泳显示,只有400多bp(正常600多bp)。
请大家交流讨论一下这是为什么?

克隆出现的奇怪现象
QQ截图20140914175959.jpg
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winner00lk

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wardwaads: 金币+3 2014-09-16 22:29:04
把你的测序峰图发出来,给你分析。另外,你比对一下载体序列,看看什么情况。下次放序列的时候记得不要截图,不然别人想帮你比对都不方便
我从远方来,没带走一丝遗憾
8楼2014-09-15 11:18:22
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普通回帖

wardwaads(金币+1): 谢谢参与
2楼2014-09-14 18:57:38
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wardwaads(金币+1): 谢谢参与
3楼2014-09-14 19:08:21
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wardwaads(金币+1): 谢谢参与
祝福
4楼2014-09-14 19:09:05
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5楼2014-09-14 19:20:33
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6楼2014-09-15 00:18:26
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lance-tan

金虫 (小有名气)

请问楼主检测挑取克隆子片段正确否,是否为阳性克隆?
新手入门求各位大神指导
7楼2014-09-15 10:24:50
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wardwaads

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by winner00lk at 2014-09-15 11:18:22
把你的测序峰图发出来,给你分析。另外,你比对一下载体序列,看看什么情况。下次放序列的时候记得不要截图,不然别人想帮你比对都不方便

序列:
GGCTCTTCGGGCGTGATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGATTAACGCGAAGAACCTTACCGGGTCTTGTACACACCGAGGTCTTGTACACACCGGGGTCTTGTACACACCGAGCGGGCGGGTCTTGTACACACCTTACGCCCGCCGCGGGTCTTGTACACACCGACCGTCACACCATGGGTCTTGTACACACCGACGTGAACGCGAAGAACCTTACGGGTCTTGTACACACCGACGTGAACGCGAAGAACCTTACCAGGGTCTTGTACACACCGACGTGAACGCGAAGAACCTTACCGTGCGGGTCTTGTACACACAATCGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCTCTTCCGCTTCCTCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACTCAAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAACGCAGGAAAGAACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGT
多谢你!峰图我以附件发上
9楼2014-09-16 22:25:09
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wardwaads

银虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wardwaads at 2014-09-16 22:25:09
序列:
GGCTCTTCGGGCGTGATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGATTAACGCGAAGAACCTTACCGGGTCTTGTACACACCGAGGTCTTGTACACACCGGGGTCTTGTACACACCGAGCGGGCGGGTCTTGTACACACCTTACGCCCGCCGCGGGTCTTGTACACACCGACCGTCACACCATGGGTC ...

这是峰图的地址:
http://pan.baidu.com/s/1bnAMtJL
多谢!
10楼2014-09-16 22:28:30
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