24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 14489  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

aini_1314

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教几个和Protein Thermal Shift( ThermoFluor)有关的问题,有对RT-PCR了解的也可以 已有2人参与

背景简介(做过的可以略过):
Protein Thermal Shift( ThermoFluor),就是测蛋白质热转变稳定性的一种技术,属于RT-PCR技术的一种衍生用法。可以高通量的对蛋白进行筛选,蛋白与配体的相互作用等。具体信息可以参见wiki百科。http://en.wikipedia.org/wiki/Thermal_Shift_Assay
A thermal shift assay, also called Differential Scanning Fluorimetry (DSF) is a thermal-denaturation assay that measures the thermal stability of a target protein and a subsequent increase in protein melting temperature upon binding of a ligand to the protein.
Life公司也推出了相关的产品:
http://www.lifetechnologies.com/ ... -thermal-shift.html
具体原理可以简单的理解为,蛋白有疏水区结构,隐藏在内部,在温度上升时,蛋白的结构会被打开,暴露出疏水区,荧光染料Sypro Orange就可以与该区域进行结合,并被激发荧光。在有配体(小分子)结合的情况下,蛋白稳定性会上升,表现为熔解温度的上升(>4℃)。
实验过程:
本实验中使用的是Bio-rad 公司的RT-PCR仪,利用CFX Manager(Data Analysis)生成的数据如图所示:
请教几个和Protein Thermal Shift( ThermoFluor)有关的问题,有对RT-PCR了解的也可以
左图为蛋白熔解曲线,右图为对温度求导曲线(负值)。
在实验中设置了对照组,即图中红色线,加入配体(小分子)后的实验曲线为绿色线。
问题1,为何实验组的熔解曲线峰值偏低?
问题2,从该熔解曲线看,是否可以认为蛋白与小分子有相互作用?
问题3(略业余),Bio-rad公司给出的分析程序为何要将导数曲线取负值?
问题4,在类似的有荧光的反应中,如果反应体系中出现沉淀,是否会造成荧光值的剧烈变化?(数量级的变化)
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈陈陈梦

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ltxg123 at 2019-11-22 18:29:24
你好,新手,想请教一下,做蛋白热漂移实验拿到数据之后应该怎么进行分析呢?

你好,你会分析了吗

发自小木虫Android客户端
5楼2020-12-07 15:19:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

普鲁旺斯花季

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主,你好,我最近也在做这个实验。用的是BioSystems的PCR仪,做出的结果问题很大,主要是不知道选择哪一种reporter ,之前做的时候选的是ROX,其他还有 SYBR green,FAM等。想问你是具体怎么做的
一生转而得一夏,当司掌好年华
2楼2017-08-21 12:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ltxg123

新虫 (初入文坛)

你好,新手,想请教一下,做蛋白热漂移实验拿到数据之后应该怎么进行分析呢?
3楼2019-11-22 18:29:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈陈陈梦

新虫 (初入文坛)

我也是新手,联系方式微信:mm05090509,希望有人一起交流

发自小木虫Android客户端
4楼2020-12-07 15:19:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 290调剂生物0860 +36 哇哈哈,。 2026-04-11 42/2100 2026-04-15 13:13 by 西北望—风沙
[考研] 材料专业344求调剂 +17 hualkop 2026-04-10 22/1100 2026-04-14 16:21 by sxdj2
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +9 xu@841019 2026-04-11 10/500 2026-04-14 08:48 by 木木mumu~
[考研] 本科西工大 324求调剂 +5 wysyjs25 2026-04-10 5/250 2026-04-13 23:08 by pies112
[考研] 求调剂,985材料与化工348分 +9 涵竹刘 2026-04-11 14/700 2026-04-13 22:26 by 涵竹刘
[考研] 2本,初试303,0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 303求调剂 +14 SereinQ 2026-04-10 15/750 2026-04-11 20:43 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +3 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 14:13 by luhong1990
[考研] 283求调剂 +22 那个噜子 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 10:41 by 逆水乘风
[考研] 087100初试311求调剂 +4 任雅琴 2026-04-09 4/200 2026-04-11 10:33 by zhq0425
[考研] 机械专硕270求调剂,接受跨专业 +12 老师看看我吧aba 2026-04-09 14/700 2026-04-11 10:21 by laoshidan
[考研] 农业管理302分求调剂 +3 xuening1 2026-04-10 3/150 2026-04-11 10:18 by zhq0425
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +11 LZH(等待调剂中 2026-04-10 11/550 2026-04-11 08:39 by zhq0425
[考研] 计算机类求调剂,22408-274分 +7 上岸de小虫 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:56 by fxue1114
[考研] 一志愿京区985,085401,与本科专业一致,电子信息工程, +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 一志愿京区985,085401电子信息,本科电子信息 +3 阳光开朗的男孩 2026-04-10 3/150 2026-04-10 16:29 by sophia_93
[考研] 一志愿沪9,326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +9 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-09 10/500 2026-04-09 20:01 by Orcid
[考研] 349学科化学045106求调剂,化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
信息提示
请填处理意见