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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 高通量测序，问一个一直以来比较困惑的问题
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bitezhu

新虫 (初入文坛)

[交流] 高通量测序，问一个一直以来比较困惑的问题

所谓双端测序，是测合成的双链cDNA的哪一条链呢？还是说同时从双链的两端开始测，得到ＰＥ测序数据？
问题有点弱智，还请各位不吝赐教
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1楼 2014-08-26 22:18:24
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hmudqzj

木虫 (小有名气)
★
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cDNA一般是单链的，双端测序是指在read的两端都测一段序列
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16楼2014-12-03 17:30:04
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catinshen

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
是从双链中每条链的5’端各测一条read。
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12楼2014-08-27 11:11:56
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bitezhu

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by catinshen at 2014-08-27 11:11:56
是从双链中每条链的5’端各测一条read。

可是如果这样的话，比如说我的cDNA片段是300bp的，如果是从单链的5‘端分别测，采取PE100的策略的话，两个reads中间就没有重叠部分，拼接的时候又是怎么根据reads的overlap进行组装的呢？
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13楼2014-08-29 09:22:23
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