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空间分布函数
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各位大神,本人最近在学习画空间分布函数的图形,图1是本人自己得到的结果,但是对比图2(J. Am. Chem. Soc. 131, 2009, 15828. )中的空间分布函数图,我画出的图形不平滑而且不是很连续,虽然我尝试把势能面值调小,可以使图形连续起来, 但是图形的厚度很不均一。我把碳管放进去后发现碳管的位置不在中心(见图3)(注明:碳管的坐标没有变动)。请各位大神帮忙分析下问题出在什么地方,非常感谢!
图1.png
图2.png
图3.png
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2014-08-08 21:30:54
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4楼
:
Originally posted by
jerkwin
at 2014-08-08 23:17:40
多做, 一直做到收敛
如果只是为显示平滑, 可以对数据进行插值平滑
中心不一致可能是因为计算时候没有进行坐标变换
http://jerkwin.github.io/2014/05/13/%E7%A9%BA%E9%97%B4%E5%88%86%E5%B8%83%E5%87%BD%E6%95% ...
我先根据你提供给我的网站的信息先看看能不能解决问题哈,非常感谢。
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2014-08-09 08:27:32
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很有帮助
2014-08-09 08:27:43
想要平滑的话, 需要用很多帧构型进行平均
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2014-08-08 21:43:54
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2楼
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Originally posted by
jerkwin
at 2014-08-08 21:43:54
想要平滑的话, 需要用很多帧构型进行平均
我上面的结构是用40000个构型统计平均得到的。
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2014-08-08 21:52:54
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3楼
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Originally posted by
568286346
at 2014-08-08 21:52:54
我上面的结构是用40000个构型统计平均得到的。...
多做, 一直做到收敛
如果只是为显示平滑, 可以对数据进行插值平滑
中心不一致可能是因为计算时候没有进行坐标变换
http://jerkwin.github.io/2014/05 ... %E5%9B%BE%E7%A4%BA/
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