24小时热门版块排行榜    

查看: 1191  |  回复: 2

992648352

银虫 (小有名气)

[求助] 关于GEMC模拟相平衡的一些问题。

我使用的是MCCCS Towhee来模拟纯物质的共存曲线,每次模拟还是碰到很多类似问题,现在想就我碰到的问题请教一下大家:
1、体积的设定:两相体积的设定,文献Sample Text给的建议是总体积的设定最好保证20%的粒子数目在气相。不知道大家是怎么看这个建议的。在低温的时候20%的粒子在气相会造成气相的体积非常之大,有的时候汽液相体积之比在10以上了这样做会不会影响模拟?
2、各种概率的设置:很多文献(Ilja Siepm ann的系列文章中都有提到)上写的是体积和粒子交换(swap)这两个移动概率要保证在5~10个cycles之内分别有一次被接受;
      我是这样做的,体积概率 P 的设置:N(分子数)*nsteps(循环数)*0.5(接受概率)*P(体积变化的概率)=nsteps(循环数)/(5~10);
       swap的概率这个起初我是随便给的0.3左右,先跑个10000cycles再看看接受的swap数目{两部分(box1到box2+box2到box1)}的大小,再根据情况调试,比如:10000cycles有3000次接受。说明swap概率大了,需要适当调小;500次被接受说明需要适当增大;剩下的概率均分给其他的移动。但是,问题出现在低温的情况,低温的swap就算给到了65%也满足不了5~10个cycles之内分别有一次被接受,并且有些文献有说,除去体积和swap的概率,剩下的概率要不要小于50%。不知道大家是怎么分配的。
3、模拟的平衡与否的判断条件:看文献写的是有明显的不变的汽液密度,说明达到了平衡。但是我模拟的时候汽液密度一直是波动的,而且波动还是挺大的,我想是不是我的步数不够,就一直接着跑,但是看起过来他就是达不到平衡(收敛)。文献上都说的一般都是10000~25000达到平衡,接着另外20000~40000产出。我都快10w步还没看到平衡。。。。。。一开始接触MC时候,不是说看体系的总能量减小吗,Metropolis抽样法不是朝着能量小的构型去构建马尔科夫链的吗?为什么结果总是看到总能量(box1+box2)在不断的减小又增大(有时差一个数量级)。
4、总觉得小木虫上很少有关于分子模拟在汽液平衡这方面的交流,不知道队伍啥时候能壮大....
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

992648352

银虫 (小有名气)

有没有觉得气相的平动和转动的最大位移经常达到最大,是的接受概率几乎达到100%与想要的50%相差甚远。。。
2楼2014-07-23 09:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

草田露

银虫 (初入文坛)

帮顶!!!!
3楼2015-09-07 09:04:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 992648352 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-28 01:23 by xxniao123
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 XLGfUIdOmEAO 2026-08-27 4/200 2026-08-27 22:26 by 3RAFyYXYSwGS
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金不中,共勉 +10 eulota 2026-08-26 10/500 2026-08-27 17:23 by lqllinqiaoli
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见