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关于GEMC模拟相平衡的一些问题。
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我使用的是MCCCS Towhee来模拟纯物质的共存曲线,每次模拟还是碰到很多类似问题,现在想就我碰到的问题请教一下大家: 1、体积的设定:两相体积的设定,文献Sample Text给的建议是总体积的设定最好保证20%的粒子数目在气相。不知道大家是怎么看这个建议的。在低温的时候20%的粒子在气相会造成气相的体积非常之大,有的时候汽液相体积之比在10以上了这样做会不会影响模拟? 2、各种概率的设置:很多文献(Ilja Siepm ann的系列文章中都有提到)上写的是体积和粒子交换(swap)这两个移动概率要保证在5~10个cycles之内分别有一次被接受; 我是这样做的,体积概率 P 的设置:N(分子数)*nsteps(循环数)*0.5(接受概率)*P(体积变化的概率)=nsteps(循环数)/(5~10); swap的概率这个起初我是随便给的0.3左右,先跑个10000cycles再看看接受的swap数目{两部分(box1到box2+box2到box1)}的大小,再根据情况调试,比如:10000cycles有3000次接受。说明swap概率大了,需要适当调小;500次被接受说明需要适当增大;剩下的概率均分给其他的移动。但是,问题出现在低温的情况,低温的swap就算给到了65%也满足不了5~10个cycles之内分别有一次被接受,并且有些文献有说,除去体积和swap的概率,剩下的概率要不要小于50%。不知道大家是怎么分配的。 3、模拟的平衡与否的判断条件:看文献写的是有明显的不变的汽液密度,说明达到了平衡。但是我模拟的时候汽液密度一直是波动的,而且波动还是挺大的,我想是不是我的步数不够,就一直接着跑,但是看起过来他就是达不到平衡(收敛)。文献上都说的一般都是10000~25000达到平衡,接着另外20000~40000产出。我都快10w步还没看到平衡。。。。。。一开始接触MC时候,不是说看体系的总能量减小吗,Metropolis抽样法不是朝着能量小的构型去构建马尔科夫链的吗?为什么结果总是看到总能量(box1+box2)在不断的减小又增大(有时差一个数量级)。 4、总觉得小木虫上很少有关于分子模拟在汽液平衡这方面的交流,不知道队伍啥时候能壮大.... |
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2楼2014-07-23 09:28:37
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