24小时热门版块排行榜    

查看: 1218  |  回复: 2

992648352

银虫 (小有名气)

[求助] 关于GEMC模拟相平衡的一些问题。

我使用的是MCCCS Towhee来模拟纯物质的共存曲线,每次模拟还是碰到很多类似问题,现在想就我碰到的问题请教一下大家:
1、体积的设定:两相体积的设定,文献Sample Text给的建议是总体积的设定最好保证20%的粒子数目在气相。不知道大家是怎么看这个建议的。在低温的时候20%的粒子在气相会造成气相的体积非常之大,有的时候汽液相体积之比在10以上了这样做会不会影响模拟?
2、各种概率的设置:很多文献(Ilja Siepm ann的系列文章中都有提到)上写的是体积和粒子交换(swap)这两个移动概率要保证在5~10个cycles之内分别有一次被接受;
      我是这样做的,体积概率 P 的设置:N(分子数)*nsteps(循环数)*0.5(接受概率)*P(体积变化的概率)=nsteps(循环数)/(5~10);
       swap的概率这个起初我是随便给的0.3左右,先跑个10000cycles再看看接受的swap数目{两部分(box1到box2+box2到box1)}的大小,再根据情况调试,比如:10000cycles有3000次接受。说明swap概率大了,需要适当调小;500次被接受说明需要适当增大;剩下的概率均分给其他的移动。但是,问题出现在低温的情况,低温的swap就算给到了65%也满足不了5~10个cycles之内分别有一次被接受,并且有些文献有说,除去体积和swap的概率,剩下的概率要不要小于50%。不知道大家是怎么分配的。
3、模拟的平衡与否的判断条件:看文献写的是有明显的不变的汽液密度,说明达到了平衡。但是我模拟的时候汽液密度一直是波动的,而且波动还是挺大的,我想是不是我的步数不够,就一直接着跑,但是看起过来他就是达不到平衡(收敛)。文献上都说的一般都是10000~25000达到平衡,接着另外20000~40000产出。我都快10w步还没看到平衡。。。。。。一开始接触MC时候,不是说看体系的总能量减小吗,Metropolis抽样法不是朝着能量小的构型去构建马尔科夫链的吗?为什么结果总是看到总能量(box1+box2)在不断的减小又增大(有时差一个数量级)。
4、总觉得小木虫上很少有关于分子模拟在汽液平衡这方面的交流,不知道队伍啥时候能壮大....
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

992648352

银虫 (小有名气)

有没有觉得气相的平动和转动的最大位移经常达到最大,是的接受概率几乎达到100%与想要的50%相差甚远。。。
2楼2014-07-23 09:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

草田露

银虫 (初入文坛)

帮顶!!!!
3楼2015-09-07 09:04:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 992648352 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-18 01:04 by cITaGg3p5edr
[基金申请] 国社科系统bug了,是不是要放榜了? +5 kynobel 2026-09-16 6/300 2026-09-17 21:37 by tosogo
[有机交流] 各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件? 20+3 zapen 2026-09-15 7/350 2026-09-17 16:40 by 北京莱茵编辑
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 5BDX0d0WFp7t 2026-09-15 3/150 2026-09-17 16:27 by 0ngsZVSCTS7z
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:27 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:15 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:53 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:53 by ObVzqQQh1rrE
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:17 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-17 13:15 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-17 02:38 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-17 01:16 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-16 22:26 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 6/300 2026-09-16 17:27 by i3KBRD19ERkG
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-16 03:14 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-16 02:50 by DgNGHc3h5tPl
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:59 by CgyNCDVNhGVg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:46 by C79jjtjAKjEn
信息提示
请填处理意见