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使用mopac2012做完结构优化后如何从.out文件中得到结构呢？ 已有4人参与
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很简单，你找 ATOM CHEMICAL X Y Z NUMBER SYMBOL (ANGSTROMS) (ANGSTROMS) (ANGSTROMS) 1 C -1.09107905 * -1.57543613 * -0.30187106 * 2 C -0.28823482 * -1.22990859 * 0.78467546 * 3 C 0.31230698 * 0.03865173 * 0.78219605 * 把 1 C -1.09107905 * -1.57543613 * -0.30187106 * 2 C -0.28823482 * -1.22990859 * 0.78467546 * 3 C 0.31230698 * 0.03865173 * 0.78219605 * 这些复制到excel里，就是结构，稍作处理就可以用了 |
6楼2014-07-12 17:02:14
chengjienjut
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7楼2014-07-12 17:02:58
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可以参考此贴 将MOPAC2012的几何优化过程转换为xyz轨迹文件的小工具 http://hi.baidu.com/sobereva/item/02416ec7f5676010505058e2 利用此工具和VMD程序，不仅可以观看最后优化的结构，还可以看优化过程，十分方便 |
9楼2014-07-12 22:59:51
1334590579
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