24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2589  |  回复: 8

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 油水界面的分子动力学模拟 已有2人参与

建立了一个完全混溶的氯仿和水二元溶液盒子(1229个水分子+276个氯仿分子,盒子大小3.5*3.5*6.0nm),想通过模拟使它们油水分离,但是电脑跑了一天,步长1fs,模拟时间800ps,从3D图像上看不出分离,试了好几次都是这样,求解是怎么回事
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

逆风奔跑。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
CQU_wjq: 金币+10, 有帮助 2014-07-12 15:43:03
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-07-16 16:23:49
1 可能时间太短了,要几ns
2 1fs太大,0.几才行
快乐吧
2楼2014-07-10 23:47:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞行鸟 at 2014-07-10 23:47:28
1 可能时间太短了,要几ns
2 1fs太大,0.几才行

我是按照文献里的对象和条件设置的,但是一点油水分离的迹象都看不出来,所以我在想会不会是其他地方设错了
逆风奔跑。
3楼2014-07-11 08:58:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

★ ★
CQU_wjq(月只蓝代发): 金币+2, 感谢指导! 2014-07-16 16:24:10
最好发下文献
不过我好像找到那篇文献了
文献用的amber力场
MS里你可能用的力场不适合做油水分离

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 阴离子表面活性剂在油水界面聚集的分子动力学模拟.pdf
  • 2014-07-11 10:08:21, 4.6 M
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2014-07-11 10:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

MS做油水分离你可以参考创腾初级教程中《计算共存相之间的界面张力》,是用DPD做的,可以看到油水分离现象,涉及表面活性剂的话也可以DPD,有文献的,你可以找找

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2014-07-11 10:14:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2014-07-11 10:06:21
最好发下文献
不过我好像找到那篇文献了
文献用的amber力场
MS里你可能用的力场不适合做油水分离

我是用discover算的,compass力场
逆风奔跑。
6楼2014-07-11 10:38:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2014-07-11 10:14:28
MS做油水分离你可以参考创腾初级教程中《计算共存相之间的界面张力》,是用DPD做的,可以看到油水分离现象,涉及表面活性剂的话也可以DPD,有文献的,你可以找找

恩,我看一下
逆风奔跑。
7楼2014-07-11 10:40:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
CQU_wjq: 金币+5, 有帮助 2014-07-13 20:06:33
本帖仅楼主可见
8楼2014-07-13 19:51:42
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-07-13 19:51:42
1.考虑力场的问题,很容易想见排斥势参数越大肯定越容易分离
2.timestep和run time的影响,若你的体系timestep unit是fs的话考虑1fs或是0.5fstimestep,另外模拟时间应该在10ns,你跑的时间太短

谢谢啦
逆风奔跑。
9楼2014-07-13 20:06:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 CQU_wjq 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +4 cs0106 2026-04-05 4/200 2026-04-05 22:49 by lbsjt
[考研] 0703调剂,一志愿天津大学319分 +7 haaaabcd 2026-04-05 7/350 2026-04-05 22:25 by dongzh2009
[考研] 262求调剂 +7 天下第一文 2026-04-04 8/400 2026-04-05 21:31 by 激流勇渡
[考研] 086000生物与医药 初试274求调剂 +6 小叮当来了 2026-03-30 7/350 2026-04-05 20:30 by lys0704
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358求调剂 +4 cs0106 2026-04-04 4/200 2026-04-05 18:46 by imissbao
[考研] 385分 生物学(071000)求调剂 +11 qf626 2026-04-01 11/550 2026-04-05 17:35 by Ecowxq666!
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-04-04 5/250 2026-04-05 14:06 by imissbao
[考研] 081700学硕,323分,一志愿中国海洋大学求调剂学校 +16 披星河 2026-04-04 16/800 2026-04-05 11:27 by 猪会飞
[考研] 295求调剂 +10 xndjjj 2026-04-04 10/500 2026-04-05 11:19 by 猪会飞
[考研] 0703化学 +12 妮妮ninicgb 2026-04-04 13/650 2026-04-05 10:46 by 啊俊!
[考研] 一志愿西北农林畜牧专硕336分求调剂 +3 5ourr 2026-04-03 3/150 2026-04-05 10:40 by JOKER0401
[考研] 数一英一 347 人工智能国奖论文都有求调剂 +3 乌拉儿山脉 2026-03-30 7/350 2026-04-05 10:32 by zhq0425
[考研] 283分求调剂 +9 试试看呗 2026-04-04 9/450 2026-04-05 10:27 by 果冻大王
[考研] 301求调剂 +12 121. 2026-04-04 12/600 2026-04-05 09:00 by 来看流星雨10
[考研] +5 化工专硕323分 2026-04-04 5/250 2026-04-05 08:02 by 544594351
[考研] 283求调剂 +4 mcbbc 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:51 by imissbao
[考研] 363求调剂 +7 zh096 2026-04-04 7/350 2026-04-04 17:13 by dongzh2009
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-03-31 4/200 2026-04-04 13:34 by 1753564080
[考研] 268求调剂 +8 你好tg 2026-04-03 9/450 2026-04-04 05:08 by gswylq
[考研] 求材料调剂,一志愿郑州大学289分 +15 硕星赴 2026-04-03 15/750 2026-04-04 01:01 by userper
信息提示
请填处理意见