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zxlulurain

新虫 (初入文坛)

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虫号: 2019866
注册: 2012-09-21
专业: 胰腺外分泌功能异常与胰腺

[求助] CHIP超声条件请各位做过的大神给点建议已有3人参与

刚刚开始做chip，实验室是sonics VCX130超声破碎仪，探头是2mm的，要破碎的体积大约是200-400ul，细胞是sw1990和panc-1，请各位做过chip的虫友们给出点点子，超声破碎的条件多少功率，冲击几秒，间歇几秒，几个循环比较合理，可以破碎到所需要的DNA片段。

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1楼 2014-06-18 11:32:25

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流连客

新虫 (初入文坛)

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专业: 生殖生物学

引用回帖:

5楼: Originally posted by wallen379 at 2014-07-02 23:59:56
做ChIP第一步就是去确定超声的条件，这个具体超声参数肯定是需要自己去摸索的，因为每个人不同的机器和材料以及溶剂就有不同的方法。
以下是我个人总结的一些超声需要注意的事项：
1.片段长度，如果是只做ChIP-PC ...

请问你有没有用过covaris s220的超声仪？实验室按照200bp推荐参数总是得到100左右或100bp以下的片段。