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mac1257

新虫 (初入文坛)

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[求助] 构象问题（MOE）已有1人参与

请教MOE的高手，
用其做DOCKING的时候，有时候论文里面对小分子会做构象，Generation of Ligand Conformers；
而有时候就是用原始的小分子三维结构来进行对接。这是为什么呢？
我发现软件的docking模块里面有rotated bonds这个选项，这又什么联系吗？

多谢!

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1楼 2014-06-10 17:20:00

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爱笑的岛民

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

★ ★
mac1257(月只蓝代发): 金币+2, 感谢指导！ 2014-06-17 15:58:34

理论上做分子对接的时候是需要产生小分子构象的，如果只用一种构象进行对接，得到的结果比较有限，docking面板中的rotated bonds是指允许小分子的旋转键转动，但是这种旋转是一定范围内的，构象变化比较小。

2楼2014-06-16 22:47:46

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