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mac1257

新虫 (初入文坛)

[求助] 构象问题(MOE) 已有1人参与

请教MOE的高手,
用其做DOCKING的时候 ,有时候论文里面对小分子会做构象,Generation of Ligand Conformers;
而有时候就是用原始的小分子三维结构来进行对接。这是为什么呢?
我发现软件的docking模块里面有rotated bonds这个选项,这又什么联系吗?

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爱笑的岛民

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
mac1257(月只蓝代发): 金币+2, 感谢指导! 2014-06-17 15:58:34
理论上做分子对接的时候是需要产生小分子构象的,如果只用一种构象进行对接,得到的结果比较有限,docking面板中的rotated bonds是指允许小分子的旋转键转动,但是这种旋转是一定范围内的,构象变化比较小。
2楼2014-06-16 22:47:46
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