| 查看: 4934 | 回复: 11 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
jianchen7882金虫 (小有名气)
|
[求助]
gromacs氢键分析工具，g_hbond输出结果解析？ 已有1人参与
|
||
| 如题，请教各位大神，g_hbond分析工具输出的结果有三列，第一列是时间，后两列是氢键数量，这里分析的是受体和配体拉伸时的氢键数量，请问为啥是两列氢键数量啊？？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 氢键 |
» 猜你喜欢
让我中一个面上吧！
已经有16人回复
-
放榜前的不淡定
已经有17人回复
-
科研孤儿太难了
已经有19人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有9人回复
-
明天应该可查了！？
已经有4人回复
-
什么时候开奖？
已经有11人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有6人回复
-
建议基金发布提前给出明确的时间点
已经有14人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有17人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教gromacs蛋白与小分子相互作用分析
已经有12人回复
- 【菜鸟求助】gromacs如何计算大分子和小分子间的非共价键力？？
已经有13人回复
- 菜鸟求助。用gromacs的什么指令可以分析氢键能大小？
已经有6人回复
- gromacs结果分析怎样分析氢键能和结合能
已经有12人回复
- Gromacs怎么分析氢键存活时间？
已经有13人回复
- 【求助】求助Gromacs中关于g_hbond的out文件的问题
已经有10人回复
jianchen7882
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1406
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 76.1小时
- 虫号: 2182099
- 注册: 2012-12-12
- 性别: GG
- 专业: 分离过程
5楼2014-06-11 09:33:34
水儿CoCo
木虫 (小有名气)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 2597.7
- 红花: 7
- 帖子: 120
- 在线: 96.8小时
- 虫号: 2718708
- 注册: 2013-10-12
- 性别: MM
- 专业: 药物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jianchen7882: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 答案在后面，挺好的，谢谢 2014-06-14 08:27:43
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-06-17 15:57:08
感谢参与，应助指数 +1
jianchen7882: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 答案在后面，挺好的，谢谢 2014-06-14 08:27:43
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-06-17 15:57:08
| 得出的文件里最上面非数据那几行里有写明是什么，楼主注意打开来看看就知道了 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2014-06-10 15:09:18
jianchen7882
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1406
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 76.1小时
- 虫号: 2182099
- 注册: 2012-12-12
- 性别: GG
- 专业: 分离过程
送红花一朵 |
谢谢，输出参数如下，具体解释一下好吗，谢谢！！1 # This file was created Mon May 26 20:35:37 2014 # by the following command: # g_hbond -f traj.xtc -s pull.tpr -num num.xvg # # g_hbond is part of G R O M A C S: # # GROningen Mixture of Alchemy and Childrens' Stories # "@ title ""Hydrogen Bonds""" "@ xaxis label ""Time (ps)""" "@ yaxis label ""Number""" @TYPE xy "@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85" @ legend on @ legend box on @ legend loctype view "@ legend 0.78, 0.8" @ legend length 2 "@ s0 legend ""Hydrogen bonds""" "@ s1 legend ""Pairs within 0.35 nm""" 0 1 3 1 1 3 2 2 1 3 4 3 4 3 1 5 2 5 6 3 1 7 3 2 8 3 1 9 3 1 |
3楼2014-06-10 20:35:47
水儿CoCo
木虫 (小有名气)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 2597.7
- 红花: 7
- 帖子: 120
- 在线: 96.8小时
- 虫号: 2718708
- 注册: 2013-10-12
- 性别: MM
- 专业: 药物化学
★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-17 15:57:22
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-17 15:57:22
|
第一列是时间，第二列是氢键数目，第三列是pairs with 0.35 nm |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
4楼2014-06-10 21:19:02
20