| 查看: 1391 | 回复: 2 | ||||
MichaelC木虫 (小有名气)
|
[求助]
新手求助晶体checkcif各类错误解决方法 已有1人参与
|
|
Alert level A PLAT770_ALERT_2_A Suspect C-H Bond in CIF: C13' -- H5A .. 1.44 Ang. ________________________________________ Alert level C PLAT094_ALERT_2_C Ratio of Maximum / Minimum Residual Density .... 2.32 Why ? PLAT341_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0066 Ang. ________________________________________ Alert level G PLAT002_ALERT_2_G Number of Distance or Angle Restraints on AtSite 4 Note PLAT003_ALERT_2_G Number of Uiso or Uij Restrained non-H Atoms ... 4 Why ? PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details in the CIF Please Do ! PLAT007_ALERT_5_G Number of Unrefined Donor-H Atoms .............. 7 Why ? PLAT045_ALERT_1_G Calculated and Reported Z Differ by ............ 0.25 Ratio PLAT072_ALERT_2_G SHELXL First Parameter in WGHT Unusually Large. 0.10 Why ? PLAT093_ALERT_1_G No su's on H-positions, refinement reported as . mixed PLAT302_ALERT_4_G Anion/Solvent Disorder ............ Percentage = 100 Note PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... # 32 Do ! N1 -CU1 -N1 -C1 -131.70 0.40 2.556 1.555 1.555 1.555 PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... # 36 Do ! N1 -CU1 -N1 -C12 44.40 0.30 2.556 1.555 1.555 1.555 PLAT794_ALERT_5_G Tentative Bond Valency for Cu1 (II) ..... 2.04 Note PLAT860_ALERT_3_G Number of Least-Squares Restraints ............. 26 Note a类错误是不是可以通过加氢键后解决？这个结构还没有加入氢键。 c类错误就完全没有头绪了。。。 有没有大神帮忙解决下，不胜感激！  |
回复此楼» 猜你喜欢
求助
已经有1人回复
-
0703化学26考研调剂，一志愿南昌大学
已经有5人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有96人回复
-
有没有化学、材料专业的同学需要调剂 考虑天津高效的可以邮件或者私信
已经有1人回复
-
26年博士招生
已经有16人回复
-
江西理工大学功能晶态材料方向刘遂军课题组招收2026年秋季入学博士研究生
已经有11人回复
-
宁夏大学团簇新材料团队招收材料/化学/化工专业博士生
已经有0人回复
-
MIL-101有单晶样品吗
已经有1人回复
-
已删除
已经有3人回复
-
收调剂研究生
已经有2人回复
-
【2026 考研调剂】哈尔滨工程大学核科学与技术学院核化工系 招收调剂生
已经有2人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 精修后，checkcif的C类错误，如何改？？？请路过的大神赐教！
已经有5人回复
- cif出现错误怎么改？
已经有3人回复
- 关于晶体结构解析中的A、B类错误的解决办法
已经有4人回复
- checkcif中B、C类错误求助
已经有3人回复
- 求助晶体check错误
已经有6人回复
- 求助checkCIF中刚性键B类错误的解释，跪求大神帮忙啊！！！
已经有3人回复
- CIF有B类错误，求帮忙修改
已经有13人回复
- checkcif BC类错误
已经有3人回复
- 求助精修cif数据及解决文件当中的A类B类C类错误
已经有5人回复
- 求助高手帮忙解析cif文件当中的A类C类错误以及精修参数是否合适等
已经有4人回复
- checkcif之后出现的问题，不知道该怎么处理，望高手指点！谢谢！
已经有9人回复
- 求助啊，懂的帮我看一下有错误没有，check cif
已经有4人回复
- checkcif中出现的A类、B类问题怎么解
已经有4人回复
- checkcif 时出现错误，怎么回事呀？？？
已经有6人回复
- cif文件checkcif时遇到的A类错误，求助各位老师同学帮忙，万分感激！
已经有5人回复
- 晶体解析，checkcife的错误不会处理，请高手指点
已经有5人回复
- 新手求助pubcif添加图片问题以及checkcif时的C类和G类问题
已经有8人回复
- 重金求助解决有机小分子checkcif错误
已经有3人回复
- check cif 中的错误
已经有11人回复
- 求助cifcheck！！
已经有4人回复
- 这个check 错误怎么解决
已经有5人回复
- CHECKCIF主要出现几个问题
已经有6人回复
- checkcif检查警告的含义
已经有11人回复
- 【求助】用checkcif文件中z值不对怎么办？
已经有3人回复
- 【求助】check CIF时遇到的一个错误 高手请进来指导一下
已经有14人回复
- 【请教】在checkcif中出现a和b错误，应该如何修改？
已经有5人回复
- 【求助】checkcif 后出现的A类错误，请高手帮忙！
已经有3人回复
- 【求助】cif check A,B类错误
已经有5人回复
jackdeng
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +759 - 应助: 674 (博士)
- 贵宾: 0.125
- 金币: 42190
- 红花: 95
- 帖子: 2244
- 在线: 341.4小时
- 虫号: 117727
- 注册: 2005-11-26
- 性别: GG
- 专业: 无机化学
- 管辖: 晶体
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
MichaelC: 金币+50, 谢谢大神 我想请教一下：什么样的G类错误需要处理？什么样的不用管啊？ 2014-06-09 09:42:50
感谢参与，应助指数 +1
MichaelC: 金币+50, 谢谢大神 我想请教一下：什么样的G类错误需要处理？什么样的不用管啊？ 2014-06-09 09:42:50
|
看来你的这个结构中存在无序的组分，A类错误是无序的C与另一个C上的H之间的距离过近，你可以在cif文件的键长部分找到这个键，然后删掉就行了； C类错误第一个说的是你最大和最小残余密度峰的比值过大，这个你要看一下结构中是否还存在着较大的Q峰，如果该Q峰处于重原子附近且与重原子间的距离比较近，那就可以解释这个问题了，第二个问题是C-C键精度过低，这是晶体本身造成的，没有办法解决，不过好在是在C类错误中，无需处理； G类错误中有几个是需要处理的：第一个 PLAT045_ALERT_1_G Calculated and Reported Z Differ by ............ 0.25 Ratio ，解决办法是用checkcif报告中calculate一列中的Z值替换你res文件中的z值，然后精修就可以了， 第二个 PLAT093_ALERT_1_G No su's on H-positions, refinement reported as . mixed ，解决办法是将cif文件中的_refine_ls_hydrogen_treatment 后的mixed改成constr就可以了， 第三个是在cif文件扭角部分找到与G类错中提到的相应角度，然后删除就可以了。其他G类错误可以不用处理。 |
2楼2014-06-07 12:48:39
jackdeng
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +759 - 应助: 674 (博士)
- 贵宾: 0.125
- 金币: 42190
- 红花: 95
- 帖子: 2244
- 在线: 341.4小时
- 虫号: 117727
- 注册: 2005-11-26
- 性别: GG
- 专业: 无机化学
- 管辖: 晶体
3楼2014-06-09 11:13:10
