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twbky木虫 (正式写手)
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[求助]
求助cifcheck!!
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在线check时出现: You have not supplied any structure factors. As a result the full set of tests cannot be run. 不知道是什么意思?为什么不能check? 谢谢!! |
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Justsoso
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【答案】应助回帖
twbky(金币+10): 谢谢! 2011-08-22 21:26:26
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在checkCIF时有两个选项: Select validation type 1-Full validation of CIF and structure factors 2-Validation of CIF only (no structure factors) 第一个选项是默认的,如果你没有改变该选项而直接点击“Send cif for checking“按钮后,则会在随后页面中出现”upload structure factor file“按钮。假如你此刻又没有提供该文件,那么在最后的报告中就会看到你帖子中提到的那句话。而采用第二个选项检查cif文件时,直接会出现“You have not supplied any structure factors. As a result the full set of tests cannot be run. ”。 关于“structure factor file“的介绍,请参见以下链接。似乎加入结构因子文件会逐渐成为趋势。 http://deposit.rcsb.org/sf_cif.html http://www.iucr.org/news/newslet ... e-factor-file-check http://alpha.rcsb.org/pdb/static ... ts/mmcif/index.html http://www.sdsc.edu/pb/cif/tutorial_mm.html 关于“structure factor file“的格式转化,请参考: http://pdb-extract.rcsb.org/auto-check/help/sf-conversion.html http://www.ebi.ac.uk/pdbe/docs/documentation/mmcif.html 建议(争议):只是一种警告,或许可以无视之。参见: http://www.publish.csiro.au/?act ... e_id=CH11264_AC.pdf http://www.rsc.org/suppdata/ce/c ... eating_checkcif.pdf |

2楼2011-08-22 14:03:02
Justsoso
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【答案】应助回帖
twbky(金币+10): 谢谢 2011-08-25 12:46:36
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补充一下,structure factor file 就是与xxx.cif同名的xxx.fcf文件(相同目录下),在随cif文件后上传fcf文件,则出现: Structure factors have been supplied for datablock(s) xxx No syntax errors found. CIF dictionaryPlease wait while processing .... Interpreting this report Structure factor report... 这应该是正解。 |

3楼2011-08-24 17:18:23
twbky
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