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moshangchenx

金虫 (正式写手)

[求助] 菌液PCR出现奇怪现象,急求大神解释已有4人参与

各位大虾,本人在做菌液PCR时出现了一种奇怪现象,在试管中摇菌菌液PCR结果正常,但将该管中的菌液扩大培养后,菌液PCR扩不出目的条带,出现了比目的条带小很多的带,急求大神指点!

菌液PCR出现奇怪现象,急求大神解释
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科研无止境,我心成蹉跎
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-06-05 08:44:56
moshangchenx: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-06-05 09:08:04
菌液PCR很容易出现假阳性,建议用其他方法验证,例如提取质粒后进行PCR验证,也可以用酶切进行验证
另外,扩大培养很有可能污染了
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
2楼2014-06-04 20:00:39
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-05 08:45:03
引用回帖:
2楼: Originally posted by 西门吹雪170 at 2014-06-04 20:00:39
菌液PCR很容易出现假阳性,建议用其他方法验证,例如提取质粒后进行PCR验证,也可以用酶切进行验证
另外,扩大培养很有可能污染了

有可能是他操作不当,菌液PCR检测我们常做的,没有问题

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-06-04 20:07:58
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-06-05 08:45:09
moshangchenx: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-06-05 09:09:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-06-04 20:07:58
有可能是他操作不当,菌液PCR检测我们常做的,没有问题
...

3泳道扩增出来的结果的确有很大的问题。一般菌液PCR是可以扩增出目的条带的,只不过会含有很多杂带,但是特异的那一条带还是有的。不过也不能排除特殊情况,本实验室一般都是粗抽质粒电泳,然后用质粒进行PCR。楼主的扩大培养很有可能出现了污染。
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
4楼2014-06-04 20:25:15
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meng_xu

铜虫 (小有名气)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-05 08:45:19
还是小体系的提取质粒,然后转化,再加大培养体积,比较好
5楼2014-06-05 05:40:17
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-05 08:45:23
你的质粒有多大,貌似1、2是质粒,不是扩增产物
6楼2014-06-05 08:42:07
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kx444555

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-06-05 08:49:24
moshangchenx: 金币+1, 有帮助 2014-06-05 09:10:14
估计污染了,最好再加一个不带质粒的菌做PCR,当做阴性对照,
星陈代谢
7楼2014-06-05 08:46:38
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 西门吹雪170 at 2014-06-04 20:00:39
菌液PCR很容易出现假阳性,建议用其他方法验证,例如提取质粒后进行PCR验证,也可以用酶切进行验证
另外,扩大培养很有可能污染了

我已经重新转化了,觉得污染的可能性比较大,谢谢
科研无止境,我心成蹉跎
8楼2014-06-05 09:06:42
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-06-04 20:07:58
有可能是他操作不当,菌液PCR检测我们常做的,没有问题
...

菌液PCR我是第一次做,所以还是很担心的,呵呵
科研无止境,我心成蹉跎
9楼2014-06-05 09:07:20
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moshangchenx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 西门吹雪170 at 2014-06-04 20:25:15
3泳道扩增出来的结果的确有很大的问题。一般菌液PCR是可以扩增出目的条带的,只不过会含有很多杂带,但是特异的那一条带还是有的。不过也不能排除特殊情况,本实验室一般都是粗抽质粒电泳,然后用质粒进行PCR。楼主 ...

恩,污染的可能性比较大
科研无止境,我心成蹉跎
10楼2014-06-05 09:09:46
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