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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于大肠杆菌的蛋白质组学
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西岩

金虫 (小有名气)

[求助] 关于大肠杆菌的蛋白质组学 已有3人参与

向大家求助一个问题
大肠杆菌的蛋白质组检测
质谱鉴定后搜索NCBI数据库得到大肠杆菌蛋白质对应的gi号，想和其他数据库的信息作交叉比对，怎样把蛋白质的gi号注释成其他数据库如unitprot可以识别的名称呢
谢谢大家

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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长路漫浩浩
1楼 2014-05-23 09:07:35
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西岩

金虫 (小有名气)
是uniprot 抱歉爪机打字失误

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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长路漫浩浩
2楼2014-05-23 09:08:47
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看你要Uniprot的链接，那就是蛋白质了，这个很好PICR http://www.ebi.ac.uk/Tools/picr/
还可以编程来访问http://www.ebi.ac.uk/Tools/picr/RESTDocumentation.do
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3楼2014-05-23 19:22:31
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西岩

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2014-05-23 19:22:31
看你要Uniprot的链接，那就是蛋白质了，这个很好PICR http://www.ebi.ac.uk/Tools/picr/
还可以编程来访问http://www.ebi.ac.uk/Tools/picr/RESTDocumentation.do

多谢啦  

我之前试着用了PIR的ID Mapping，但是能给出交叉比对信息的蛋白质不多
http://pir.georgetown.edu/pirwww/search/idmapping.shtml

我试试PICR O(∩_∩)O
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长路漫浩浩
4楼2014-05-23 22:55:49
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

哪个工具应该都行。实在不行，你可以去uniprot直接BLAST
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5楼2014-05-24 02:12:15
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馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

http://biodbnet.abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php或uniprot的mapping功能
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6楼2014-06-09 17:08:09
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20055838

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

uniprot里不是有ID maping吗？
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7楼2014-06-10 14:24:38
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