应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 电荷密度图缺少原子
51/1返回列表
查看: 3342  |  回复: 22
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

paopaotu326

金虫 (正式写手)

[求助] 电荷密度图缺少原子 已有2人参与

大家好，我是新手，最近在学习电荷密度图和差分电荷密度图的做法，我根据学习的结果，得出两个结论：
（1）电荷密度图，就是对于一个分子AB2，进行静态自洽计算后，得到CHGCAR文件，然后直接作图，得到电荷密度图；
（2）差分电荷密度图，就是对这个分子构成的元素A和B，分别计算其CHGCAR后，得到CHGCAR1和CHGCAR2，用（1）得到的电荷密度，减去CHGCAR1和CHGCAR2*2，就是差分密度了。
     不知分析对否？请大家帮助了。
      如果正确，问题来了，大家看我下面的图1，是SnO2的电荷密度图，为什么小的O原子都有显示出计算的电荷密度分布，而大原子的Sn为什么没有显示出来？我用vesta来取截面，结果一样，只显示O原子，没有Sn原子，可图2上清楚看出来，Sn原子和氧原子在（1 -1 0）面上是共面的，图3中却少了Sn原子的电荷密度？
      百思不得其解，是不是计算的时候哪里设置不对？还是我对电荷密度图的理解有差？
      请大家帮忙吧！多谢了！

电荷密度图缺少原子
图1.jpg


电荷密度图缺少原子-1
图2.jpg


电荷密度图缺少原子-2
图3.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-05-05 16:28:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苦行客

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
paopaotu326: 金币+2, ★有帮助 2014-05-06 09:29:55
你做的应该是差分电荷没错，在SnO2 体系里面，本就是O原子周围电荷密度比较多的，你想看到Sn原子的电荷，可以吧iso设置的小一点即可，iso在vesta设置！
赞一下 回复此楼
行有不得，反求诸己～
5楼2014-05-06 08:05:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 23 个回答

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-05 23:20:22
paopaotu326: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-05-06 09:29:37
你的理解是正确的，纠正一点：你做的是电荷密度差。

在你的电荷密度文件中，金属原子周围没有电荷分布，这是正常的。因为你这个是离子化合物。电子都跑到O周围去了，那么电子云的分布就会出现你现在的情况。若是你想看到更细致一些的分布，就把ISO的值小一些，可以调到你满意为止。
赞一下 回复此楼
2楼2014-05-05 20:21:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paopaotu326

金虫 (正式写手)
首先谢谢楼上，我有点明白了，但还是没有彻底明白，继续向您请教：
（1）您说我做得是“电荷密度差”？不是太明白啊。
（2）ISO的值是指哪个软件？做这个的软件太多了？
（3）我做了掺杂其它金属的结构，就可以清楚地看到它的电荷密度了，您看下图：
完蛋，这下没有办法传图了，反正就是我用一个Pd原子取代了一个Sn原子，就可以作出来相应的电荷密度图了。这是不是意味着取代Sn的Pd原子没有失去4个电子，周围还有电子，所以才能看到它周围有电荷分布？

话说，发表新帖的时候，底下可以贴上图片附件，现在回复就没有这个按钮啦，管理员出来帮忙下？嘿嘿：）
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-06 07:51:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paopaotu326

金虫 (正式写手)
http://pan.baidu.com/s/1mgukIIs
这个是刚刚学着弄的百度网盘的公开链接，也不知能不能dai'k打开呢，就是上面的图4
赞一下 回复此楼
4楼2014-05-06 07:54:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 23 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿2110，化学学硕310分，本科重点双非求调剂 +16 努力奋斗112 2026-04-08 16/800 2026-04-09 20:54 by zhouxiaoyu
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +19 土豆er? 2026-04-09 20/1000 2026-04-09 20:33 by maddjdld
[考研] 085600材料与化工301分求调剂院校 +33 刺痛jk 2026-04-06 34/1700 2026-04-09 18:31 by hy861222
[考研] 316求调剂 +3 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 3/150 2026-04-09 17:31 by wp06
[硕博家园] 新一代电子信息294求调剂 不挑学校 +5 Ytyt11 2026-04-09 6/300 2026-04-09 14:40 by Ytyt11
[考研] 求调剂 +8 吃口冰激凌 2026-04-07 8/400 2026-04-09 08:03 by 5268321
[考研] 275 求调剂 +8 Lei812514 2026-04-07 8/400 2026-04-08 12:46 by chemisry
[考研] 301求调剂 +10 细胞相关蛋白 2026-04-03 10/500 2026-04-08 10:36 by tjzhao
[考博] 申博 +8 IQwQl 2026-04-04 8/400 2026-04-08 09:43 by 0608104024
[考研] 机械工程264学硕求调剂 +3 qiushangxian 2026-04-06 3/150 2026-04-08 01:53 by Linzejun
[考研] 301求调剂 +18 121. 2026-04-04 18/900 2026-04-07 17:49 by 蓝云思雨
[考研] 软工学硕299求调剂 +6 useryy 2026-04-07 6/300 2026-04-07 09:50 by vgtyfty
[考研] 材料调剂 +5 小刘同学吖吖 2026-04-06 5/250 2026-04-06 18:34 by sherry_1901
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 12/600 2026-04-06 10:26 by 蓝云思雨
[考研] 331求调剂 +8 于征yz 2026-04-05 8/400 2026-04-06 00:54 by fmesaito
[考研] 298求调剂 +7 manman511 2026-04-05 7/350 2026-04-05 10:29 by 唐沐儿
[考研] 353求调剂 +10 MayUxw1 2026-04-03 10/500 2026-04-05 09:23 by 无际的草原
[考研] 313求调剂 +3 海日海日 2026-04-04 3/150 2026-04-05 07:48 by 544594351
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 初试成绩337找调剂 +3 ??? ?. ? 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:43 by 土木硕士招生
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭