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可慧儿

新虫 (小有名气)

[求助] 求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项! 已有2人参与

现有一种有机小分子化合物(M<600),导师提出来需要培养单晶。因为不是化学专业这块的,对本人来说,是第一次接触这个新名词。从好奇、查资料学习、按照虫板上的经验实验操作,到今天面对结果的沮丧,真心感慨单晶培养不仅仅是科学,更是一门艺术!也许我还没有踏进科学的门,那更谈不上懂艺术啦!虫虫平台里,深藏单晶培养的资深虫友,希望能得到你们的无私帮助!
化合物溶解能力:二甲基乙酰胺(7mg/ml)>二甲基甲酰胺>二氯甲烷(5mg/ml)>三氯甲烷>乙腈>四氢呋喃(低于5mg/ml)>乙酸乙酯>丙酮>苯>甲苯>乙醚(微溶),不溶于正己烷、正戊烷、正庚烷、甲醇、乙醇。其他溶剂没有试验。
以下问题,希望能得到一一回复:
    一、 同一试管内进行的液液扩散法
    1. 试管的容积最少需要多大?10ml的刻度试管能用不?
    2. 良溶剂至少需要溶解多少mg测试物?一定是要过饱和吗?
    3. 不良溶剂如何界定?是不是测试物越不溶的越好用作不良溶剂?在溶解了待测物的良溶剂上面滴加不良溶剂,出现浑浊层,再滴加良溶剂变澄清,目的是什么?继续滴加良溶剂和不良溶剂的混合液,目的又是什么?这种混合液的比例和量如何确定?所有滴加的溶剂是不是必须沿着管壁缓慢加?滴加混合液后,再加入不良溶剂,也是滴加的方法沿着管壁加?根据什么确定加入不良溶剂的量?
    二、大容器内套小容器的溶剂扩散法
    1. 待测物在良溶剂中的量至少达多少mg?也需要过饱和吗?
    2. 不良溶剂与良溶剂有量的比例要求吗?如何确定不良溶剂量?
    三、溶剂挥发法
    根据我的化合物性质,能采用溶剂挥发法吗?目前,只试了上面两种扩散法。
    那些没有成功的待测物,有什么方法回收吗?待测物如果上百次的实验,肯定不够呀
    培养过程中说是不能碰,如果是一批样品测试,那放在中间的无法观察,要拿出来看,这种矛盾如何解决?
    所有的单晶培养,对温度是有严格要求吗?必须是什么温度范围?必须是恒温吗?我目前没有这样的条件,因为,我们是药理研究实验室,没有多余的地腾给我
根据我这个化合物,希望给出一个比较好的单品培养方案!非常谢谢啦!













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11900490

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1. 试管的容积最少需要多大?10ml的刻度试管能用不?
答:可以的。

2. 良溶剂至少需要溶解多少mg测试物?一定是要过饱和吗?
答:良性溶剂溶解多少无所谓。不需要过饱和。



3. 不良溶剂如何界定?
答:就是你上面提到的正己烷、正戊烷、正庚烷、甲醇、乙醇。

是不是测试物越不溶的越好用作不良溶剂?
答:不良溶解需要和良性溶剂互溶为好。一般是乙酸乙酯+正己烷,THF+正己烷,甲苯+正己烷


在溶解了待测物的良溶剂上面滴加不良溶剂,出现浑浊层,再滴加良溶剂变澄清,目的是什么?
答:
底层:饱和的良性溶解目标分子
缓冲层:良性溶剂,少量
上层:不良溶剂。




继续滴加良溶剂和不良溶剂的混合液,目的又是什么?这种混合液的比例和量如何确定?
答:这些都是缓冲层。


所有滴加的溶剂是不是必须沿着管壁缓慢加?
答:对。防止混合。


滴加混合液后,再加入不良溶剂,也是滴加的方法沿着管壁加?
答:不良溶剂需要这样加入。
良性溶剂溶解目标分子的溶液最好是用滴管插入底部加入。目标分子最好不要挂壁。



根据什么确定加入不良溶剂的量?
答:不良溶剂没有确定的量,多点为好。




    二、大容器内套小容器的溶剂扩散法

    1. 待测物在良溶剂中的量至少达多少mg?也需要过饱和吗?
答:溶解多少不要紧,最好是接近饱和。
    2. 不良溶剂与良溶剂有量的比例要求吗?如何确定不良溶剂量?
答:没啥要求。最好是不良溶剂多些。不良溶解能和良性溶剂互溶,同时不溶解目标分子。


    三、溶剂挥发法
    根据我的化合物性质,能采用溶剂挥发法吗?目前,只试了上面两种扩散法。
答:多种方法都要试试。出的几率大些。

    那些没有成功的待测物,有什么方法回收吗?待测物如果上百次的实验,肯定不够呀
答:旋转蒸发仪。

    培养过程中说是不能碰,如果是一批样品测试,那放在中间的无法观察,要拿出来看,这种矛盾如何解决?
答:稳稳地拿住,就像端着盛水的碗一样,上层下层不混合就行。

    所有的单晶培养,对温度是有严格要求吗?必须是什么温度范围?必须是恒温吗?我目前没有这样的条件,因为,我们是药理研究实验室,没有多余的地腾给我
答:不需要,春天的温度是最好的长晶体的时间。
3楼2014-05-04 11:23:52
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11900490

木虫 (知名作家)

扩散法制备晶体--图文版

求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!
扩散法制备晶体的流程。


求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!-1
晶体析出前后对比。



求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!-2
容器是青霉素瓶子。


求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!-3
放大图,这些晶体用吸管捅下来,滤纸过滤就能测试单晶了。建议拿到测试地点操作。

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6楼2014-05-04 13:30:23
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by xing_dandan at 2014-05-04 13:56:31

        化合物在二氯甲烷中溶解度很好,2 mL能溶的量相当大啊,之前有试过1 mL溶30 mg,估计还未饱和,这样可以用二氯甲烷培养吗?
        饱和溶液需要过滤吗?微孔滤膜还是只用滤纸就可以了?
       ...

我看你上面写得是5mg/mL啊。

那样的话,1mL就够了,用个小瓶。

我们一般都过滤,不用滤膜,太麻烦。你可以用滤纸。不过我们连滤纸都不用。 我们就是用一个玻璃的吸管,里面塞上Kimwipe。就是类似擦镜纸的东西,主要是滤掉灰尘和一些颗粒。

时间的话,如果你的量少,几个小时就可以了(室温)但是不一定越快越好。低温的时间要长一点。

还有就是溶液不一定要饱和的,确保有足够的量长晶体就可以了。二氯甲烷会发的很快,你的溶液自己会达到饱和的,而且这样会延长晶体生长的时间,有利于高质量晶体的生长。

总之就是要多试,换条件,换溶剂。总有适合的条件可以长出晶体。

如果所有的条件都不行,就是你的样品不纯,或者有异构体之类的。
学无止境
12楼2014-05-05 11:20:15
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
可慧儿: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 3 Q U very much! 2014-05-04 11:51:17
给你说几个方案。我们实验室用小瓶,不用试管。挑晶体的时候容易些。

1.    4 ml 小瓶,放入2 ml 二氯甲烷的饱和溶液,上面小心的滴加5-10滴正己烷。(可以多准备几瓶,放到室温和-20度的冰箱里)
2.   4 ml 小瓶,放入2 ml 二氯甲烷的饱和溶液,上面小心的滴加5-10滴笨。(可以多准备几瓶,放到室温和5度的冰箱里)
3.  4 ml 小瓶,放入2 ml 苯的饱和溶液。(可以多准备几瓶,放到室温和5度的冰箱里)

4. 大瓶套小瓶,小瓶放二氯甲烷的饱和溶液,不良溶液用乙醚(乙醚是最常用的)。

5. 可以试试低温析出发。上面的良溶剂任选,配制饱和溶液,放到低温冰箱里,如有晶体,立刻将母液吸出,以免晶体再次被溶解。

希望对你有帮助。
学无止境
4楼2014-05-04 11:38:59
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11900490

木虫 (知名作家)

溶剂是THF+正己烷
7楼2014-05-04 13:32:11
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xing_dandan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2014-05-04 11:38:59
给你说几个方案。我们实验室用小瓶,不用试管。挑晶体的时候容易些。

1.    4 ml 小瓶,放入2 ml 二氯甲烷的饱和溶液,上面小心的滴加5-10滴正己烷。(可以多准备几瓶,放到室温和-20度的冰箱里)
2.   4 ml 小 ...


        化合物在二氯甲烷中溶解度很好,2 mL能溶的量相当大啊,之前有试过1 mL溶30 mg,估计还未饱和,这样可以用二氯甲烷培养吗?
        饱和溶液需要过滤吗?微孔滤膜还是只用滤纸就可以了?
        一般这种方法培养几天能出结果呢?最近一直在苦苦摸索中,还望不吝赐教啊
天道酬勤*_*
10楼2014-05-05 09:56:31
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11900490

木虫 (知名作家)

引用回帖:
10楼: Originally posted by xing_dandan at 2014-05-05 09:56:31

        化合物在二氯甲烷中溶解度很好,2 mL能溶的量相当大啊,之前有试过1 mL溶30 mg,估计还未饱和,这样可以用二氯甲烷培养吗?
        饱和溶液需要过滤吗?微孔滤膜还是只用滤纸就可以了?
       ...

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6640787

这个帖子就是专门为你开设的。请看看。
求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!-4
465726_1316770664_393.jpg


求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!-5
德国应用化学上的小瓶子。你可以参考一下。


求助有机小分子化合物单晶培养的详细注意事项!-6
扩散法,平行做10-20个样品。样品越多,得到晶体的时间越短。有时候一天搞定。

11楼2014-05-05 10:13:27
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普通回帖

11900490

木虫 (知名作家)

图片有没?

做个ppt 然后另存为图片,用图片来讲解,大家比较好接受。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2014-05-04 11:09:56
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可慧儿

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 11900490 at 2014-05-04 11:09:56
图片有没?

做个ppt 然后另存为图片,用图片来讲解,大家比较好接受。

没有图片,好多还不会,学习中。。。
5楼2014-05-04 11:53:04
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可慧儿

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 11900490 at 2014-05-04 13:30:23
扩散法制备晶体--图文版


扩散法制备晶体的流程。



晶体析出前后对比。




容器是青霉素瓶子。



放大图,这些晶体用吸管捅下来,滤纸过滤就能测试单晶了。建议拿到测试地点操作。...

太谢谢啦~~~
8楼2014-05-04 14:59:51
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xing_dandan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 11900490 at 2014-05-04 13:30:23
扩散法制备晶体--图文版


扩散法制备晶体的流程。



晶体析出前后对比。




容器是青霉素瓶子。



放大图,这些晶体用吸管捅下来,滤纸过滤就能测试单晶了。建议拿到测试地点操作。...

晶体这么小就可以测了么?我之前用扩散法做的,每次长成这样或者更大一些的,我就重新做了试了好多
天道酬勤*_*
9楼2014-05-05 09:08:21
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