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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求一段能生成gromacs top 文件的代码或程序
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wbn

银虫 (小有名气)

[求助] 求一段能生成gromacs top 文件的代码或程序 已有1人参与

要写好多个小分子的top file, 实在是太麻烦了。所以请问大家平时都用什么程序写 top 啊？ 我最想要的就是一段 fortran 或者 c++的代码，只要能够生成pairs, dihedrals 和 exclusions 部分的原子序号就行，力场参数我可以手动加。谢谢大家了
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1楼 2014-04-24 05:22:23
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wbn: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-04-25 01:43:44
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-04-25 17:53:30
vmd生成，然后转换
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2楼2014-04-24 07:25:22
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wbn

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-04-24 07:25:22
vmd生成，然后转换

能不能讲详细一些，具体是哪个命令，或者在manual哪一页...谢谢
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3楼2014-04-25 01:43:32
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