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问天麦饼

捐助贵宾 (小有名气)

[求助] CHGCAR的文件含义 已有3人参与

CHGCAR文件中从结构的表述结束,到第一个"augmentation occupancies"之间的数据,是各个格点上的电荷密度吗?那排列的顺序是什么,是(i,j,k)中k最优先++,比如(1,1,2),(1,1,3),(1,1,4)...这样的顺序吗?
那不同augmentation occupancies 之间的数据是什么的电荷密度?排列顺序也是如上吗?

CHGCAR的文本如下:

structure                              
   1.00000000000000     
     7.900000    0.000000    0.000000
     0.000000    3.950000    0.000000
     0.000000    0.000000   35.574300
        4     4    10    10    28
Direct
   0.749964  0.499998  0.220249
  0.000000  0.000000  0.607160
# 略去结构的语句
  0.464895  0.500013  0.163831

   80   40  360 #FFT格点的数目 80*40*360
0.93330416595E+01 0.92425257521E+01 0.90996799625E+01 0.88756023471E+01 0.85441027002E+01
0.80988155041E+01 0.75582754926E+01 0.69579894174E+01 0.63366182900E+01 0.57252477930E+01
0.51441606675E+01 0.46050406211E+01 0.41134281952E+01 0.36685557450E+01 0.32625277882E+01  # 略去后面一堆数据
augmentation occupancies   1 138
  0.2053696E+01 -0.9417135E-09  0.1246874E-05  0.5507729E-01  0.3200676E-04
-0.1217059E-01  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00   # 略去后面一堆数据
augmentation occupancies   2 138
  0.2053696E+01 -0.9417135E-09  0.1246874E-05  0.5507729E-01  0.3200676E-04
-0.1217059E-01  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00   # 略去后面一堆数据
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
问天麦饼: 金币+5 2014-04-23 10:05:07
此文件的头9行给出的体系的晶格参数,与POSCAR中的内容基本相同,在11行中三个整数分别是NGX, NGY, NGZ的值,它们表示在三个基矢方向上,对所计算的原胞进行分割,得到NGX * NGY * NGZ个点,所计算原胞中的电荷密度用一个三维矩阵A(NGX, NGY, NGZ)来存贮。
2楼2014-04-22 11:05:29
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问天麦饼

捐助贵宾 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-22 11:05:29
此文件的头9行给出的体系的晶格参数,与POSCAR中的内容基本相同,在11行中三个整数分别是NGX, NGY, NGZ的值,它们表示在三个基矢方向上,对所计算的原胞进行分割,得到NGX * NGY * NGZ个点,所计算原胞中的电荷密度 ...

那这个矩阵似乎是5列的,我是想知道具体每个数字对应哪个点
3楼2014-04-22 11:19:27
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 问天麦饼 at 2014-04-22 11:19:27
那这个矩阵似乎是5列的,我是想知道具体每个数字对应哪个点...

80   40  360
表示a方向取80个点,b方向取40个点,c方向取360个点,然后打印80*40*360个点的电荷密度。a方向的首先打印。不同的取法对应的点不同,详细解释看VASP手册中CHGCAR的说明
4楼2014-04-22 11:29:59
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问天麦饼

捐助贵宾 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-22 11:29:59
80   40  360
表示a方向取80个点,b方向取40个点,c方向取360个点,然后打印80*40*360个点的电荷密度。a方向的首先打印。不同的取法对应的点不同,详细解释看VASP手册中CHGCAR的说明...

明白了。我就是不懂,第一个数字是(0,0,0)点的密度,第二个是(0,0,1)还是(1,0,0)点的密度。那意思是(1,0,0)的密度了?
5楼2014-04-22 13:51:48
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嗨王and娜娜

木虫 (正式写手)

博士

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在前9行给出的体系的晶格参数,与POSCAR中的内容基本相同,在11行中三个整数分别是NGX, NGY, NGZ的值
努力学习!
6楼2014-04-23 09:59:32
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问天麦饼

捐助贵宾 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 嗨王and娜娜 at 2014-04-23 09:59:32
在前9行给出的体系的晶格参数,与POSCAR中的内容基本相同,在11行中三个整数分别是NGX, NGY, NGZ的值

这个我知道。我是想知道后面的数据的排列顺序
7楼2014-04-23 13:50:54
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
问天麦饼: 金币+3, ★★★★★最佳答案 2014-04-24 10:07:05
fzx2008: 金币+3, 谢谢指导 2014-04-28 19:20:48
引用回帖:
5楼: Originally posted by 问天麦饼 at 2014-04-22 13:51:48
明白了。我就是不懂,第一个数字是(0,0,0)点的密度,第二个是(0,0,1)还是(1,0,0)点的密度。那意思是(1,0,0)的密度了?...

YES


順序為
(1,1,1) (2,1,1) (3,1,1) (4,1,1) ..... (79,1,1) (80,1,1)
(1,2,1) (2,2,1) (3,2,1) (4,2,1) ..... (79,2,1) (80,2,1)
.....
....
.............. (80,40,1)
(1,1,2) (2,1,2) (3,1,2) .......
8楼2014-04-24 06:33:23
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