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jugengfans金虫 (正式写手)
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[求助]
求助！没有CHGCAR和WAVECAR生成！以前都有的，到底出了什么毛病~
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我是用openpbs送任务的，以前一直好好的，这几天发现出了如下问题： 1. 做结构优化，离子步已经进行了几步了，但CHGCAR和WAVECAR的大小都为0K！ 2. 以前送任务的时候 ，当任务运行时openpbs会在文件夹里产生两个文件。如vasp.o9715 vasp.e9715，一个存放输出文件，一个存放出错信息，现在这两个文件也找不着了！到底怎么了？ |
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jugengfans: 回帖置顶 2012-05-19 04:47:38
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接近问题的根源了！继续求助！ Job id Name User Time Use S Queue ------------------- ---------------- --------------- -------- - ----- 5922.node0 vasp land 0 Q batch 我用openpbs送了个4个节点并行的任务上去，但是它跑都不跑。 是因为硬盘没空间了吧！以前也遇到过跑到一半任务莫名奇妙终止的现象， 而以前每次清理完硬盘空间，再送任务就好了。 但是奇怪的是，我df了一下 Filesystem 1K-blocks Used Available Use% Mounted on /dev/sda3 860878904 294891556 522257216 37% / /dev/sda1 101086 13025 82842 14% /boot none 2020496 0 2020496 0% /dev/shm 还有522G的可用空间啊！为什么vasp算不了了呢！！救命！ |
7楼2012-05-19 04:47:31
redsnowolf
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15楼2012-05-25 11:30:37
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 应助指数-1, 违规存档, 非应助请不要点应助回帖 2012-05-10 14:08:44
fzx2008: 应助指数-1, 违规存档, 非应助请不要点应助回帖 2012-05-10 14:08:44
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2楼2012-05-10 13:54:23
jugengfans
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3楼2012-05-10 20:00:33
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【答案】应助回帖
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贺仪: 金币+1, 专家考核, 谢谢指教！ 2012-05-21 22:58:39
jugengfans: 金币+3, ★有帮助, 问题是，这样岂不是突然断电的话无法接着算啦~ 2012-05-23 03:58:04
贺仪: 金币+1, 专家考核, 谢谢指教！ 2012-05-21 22:58:39
jugengfans: 金币+3, ★有帮助, 问题是，这样岂不是突然断电的话无法接着算啦~ 2012-05-23 03:58:04
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只有体系的能量达到设置精度后，计算要结束了（OSIZCAR 完全输出后），才会输出WAVECAR 和 CHGCAR。我是在计算的时候盯着看的，呵呵 OSIZCAR： 43 F= -.22342121E+03 E0= -.22342121E+03 d E =-.309106E-03 N E dE d eps ncg rms rms(c) DAV: 1 -0.223420932617E+03 -0.22342E+03 -0.16281E-01 6956 0.100E+00 0.639E-02 DAV: 2 -0.223421324122E+03 -0.39151E-03 -0.43524E-03 8248 0.191E-01 0.293E-02 DAV: 3 -0.223421322520E+03 0.16020E-05 -0.12404E-04 8200 0.357E-02 0.188E-02 DAV: 4 -0.223421319851E+03 0.26686E-05 -0.18298E-05 5388 0.261E-02 44 F= -.22342132E+03 E0= -.22342132E+03 d E =-.107381E-03 N E dE d eps ncg rms rms(c) DAV: 1 -0.223421321146E+03 -0.22342E+03 -0.21027E-03 7080 0.114E-01 0.985E-03 DAV: 2 -0.223421325022E+03 -0.38758E-05 -0.52967E-05 6924 0.225E-02 45 F= -.22342133E+03 E0= -.22342133E+03 d E =-.112552E-03 N E dE d eps ncg rms rms(c) DAV: 1 -0.223421280561E+03 -0.22342E+03 -0.34872E-02 7076 0.452E-01 0.296E-02 DAV: 2 -0.223421371945E+03 -0.91384E-04 -0.10095E-03 8216 0.886E-02 0.131E-02 DAV: 3 -0.223421373468E+03 -0.15229E-05 -0.26013E-05 5284 0.151E-02 46 F= -.22342137E+03 E0= -.22342137E+03 d E =-.484466E-04 |
10楼2012-05-21 17:28:34
