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jugengfans

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-05-21 08:22:05:
那vasp到底运行了没有?

运行,但是所有文件都是空的,如wavecar,OSZICAR
pbs上面送上去了,马上就又消失掉了
11楼2012-05-23 04:11:43
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buct2010

金虫 (正式写手)


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-05-23 08:53:27
我每次让输出WAVECAR,但是断电的时候WAVECAR是空的。一般静态、能带什么的计算时间短,弛豫的话要是中断了,就把CONTCAR改成POSCAR重新算
12楼2012-05-23 08:30:47
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by jugengfans at 2012-05-23 04:11:43:
运行,但是所有文件都是空的,如wavecar,OSZICAR
pbs上面送上去了,马上就又消失掉了

既然这么说了 就很奇怪,只要任务提交上了就会产生相应的排队文件,你要不过一会儿查看,只要排上队了是肯定有的
嘟啦啦嘟啦啦嘟
13楼2012-05-23 09:03:46
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jugengfans

金虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-05-23 09:03:46:
既然这么说了 就很奇怪,只要任务提交上了就会产生相应的排队文件,你要不过一会儿查看,只要排上队了是肯定有的

还是不知道怎么回事,现在800G的空间有500G都空着,但是就是无法写入WAVECAR和CHGCAR什么的。。。要命了
14楼2012-05-25 01:05:21
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redsnowolf

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我的也是,pbs???交的作业,貌似任务资??需求??没那么高的??,???交核数过多就??算,比如我的???一个作业???交24核完全算??动,内存???用率???有0.1%,??增加核数也是一样,但如果改??16个核就跑起???了,而且很快~至于说离??弛豫一步???CHGCAR和WAVECAR大??为零的事儿,貌似vasp???在优化结????????写这两个文件,几何优化时CHGCAR文件存储的是最???一步弛豫结果对应的电???密度,和?????计算的是一样的,??过CONTCAR和CHG文件是??弛豫一步就写一次
15楼2012-05-25 11:30:37
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redsnowolf

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
jugengfans: 金币+2, 谢谢,那个用的核少能跑起来而且很快,是因为交换机的瓶颈,我这个是无论怎么送,无论几个核都写不了WAVECAR,磁盘空间空着也不屑 2012-05-26 03:52:42
我的也是,pbs提交的作业,貌似任务资源需求量没那么高的话,提交核数过多就不算,比如我的同一个作业提交24核完全算不动,内存占用率只有0.1%,再增加核数也是一样,但如果改成16个核就跑起来了,而且很快~至于说离子弛豫一步后CHGCAR和WAVECAR大小为零的事儿,貌似vasp只在优化结束后才写这两个文件,几何优化时CHGCAR文件存储的是最后一步弛豫结果对应的电荷密度,和静态计算的是一样的,不过CONTCAR和CHG文件是每弛豫一步就写一次
16楼2012-05-25 11:32:52
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redsnowolf

银虫 (小有名气)

为啥是乱码。。。
17楼2012-05-25 11:33:16
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linda19918

银虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by buct2010 at 2012-05-21 17:28:34
只有体系的能量达到设置精度后,计算要结束了(OSIZCAR 完全输出后),才会输出WAVECAR 和 CHGCAR。我是在计算的时候盯着看的,呵呵

OSIZCAR:

  43 F= -.22342121E+03 E0= -.22342121E+03  d E =-.309106E-0 ...

我也出现和楼主一样的情况,OSIZCAR都是空的,请问怎么破。。
18楼2014-03-28 12:56:01
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