| 查看: 1687 | 回复: 3 | ||
rst19860616金虫 (正式写手)
|
[求助]
SNP的置换检验（permutation test）求助 已有1人参与
|
|
本人最近在做SNP与一种疾病的关联分析（association study），由于样本量偏少些，所以想做置换检验（permutation tests）。我现在会使用Haploview做等位基因的permutation test，但对于additive model、recessive model、dominant model的permutation test就不懂怎么去做了，现诚心请教这方面的高手。如我的数据如下： healthy controls：A:147，C:117，AA:38，AC:71，CC:23; Cases：A:93，C:119，AA:20，AC:53，CC:33. 我现在对SPSS和stata有一点认识，可以在这两种软件里完成吗？方便的话，高手可以将各个步骤讲清楚些吗？谢谢。 另外，我看很多文章都有用SPSS做SNP的Hardy-Weinberg equilibrium检验，但我试了几次都不成功，高手可否将详细步骤告知呢？比如数据的输入、操作方法等。 在线急求，谢谢各位啦！ |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有255人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 将目的基因整合到哺乳动物细胞基因组上的方法有哪些？随机or定点？
已经有10人回复
- 基因组上snp位点分布的随机性如何检验？
已经有3人回复
- 浙江大学2006年分子生物学考博
已经有8人回复
rst19860616
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1357.6
- 散金: 158
- 红花: 1
- 帖子: 327
- 在线: 87.8小时
- 虫号: 916515
- 注册: 2009-11-30
- 性别: GG
- 专业: 人类遗传学
2楼2014-04-14 11:02:36
xrxleisure
铜虫 (正式写手)
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 747.3
- 散金: 110
- 红花: 1
- 沙发: 1
- 帖子: 382
- 在线: 308.5小时
- 虫号: 3155466
- 注册: 2014-04-22
- 专业: 作物分子育种
3楼2021-01-14 16:58:20
rst19860616
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1357.6
- 散金: 158
- 红花: 1
- 帖子: 327
- 在线: 87.8小时
- 虫号: 916515
- 注册: 2009-11-30
- 性别: GG
- 专业: 人类遗传学
4楼2021-04-04 21:25:01