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rst19860616金虫 (正式写手)
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SNP的置换检验（permutation test）求助 已有1人参与
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本人最近在做SNP与一种疾病的关联分析（association study），由于样本量偏少些，所以想做置换检验（permutation tests）。我现在会使用Haploview做等位基因的permutation test，但对于additive model、recessive model、dominant model的permutation test就不懂怎么去做了，现诚心请教这方面的高手。如我的数据如下： healthy controls：A:147，C:117，AA:38，AC:71，CC:23; Cases：A:93，C:119，AA:20，AC:53，CC:33. 我现在对SPSS和stata有一点认识，可以在这两种软件里完成吗？方便的话，高手可以将各个步骤讲清楚些吗？谢谢。 另外，我看很多文章都有用SPSS做SNP的Hardy-Weinberg equilibrium检验，但我试了几次都不成功，高手可否将详细步骤告知呢？比如数据的输入、操作方法等。 在线急求，谢谢各位啦！ |
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