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zhangye232

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[求助] PAGE电泳跑单个核酸序列出现4个条带让我很纠结已有1人参与

核酸序列是5‘ TTTTTTTCAACATCAGTCTGATAAGCTAGACTGATGTTGATAGCTTATCAGACTGA 3’ 巯基标记的5'端本来是希望序列是形成一个发夹结构，但是最后电泳跑出4条带出来最右边是我的那个核酸序列，，旁边是500的MAKER 最左边是20的MAKER 求大神帮忙分析

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【转】我在SDS-PAGE中所犯的错误，欢迎补充！已经有33人回复

1楼 2014-04-07 12:59:51

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pennchem

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【答案】应助回帖

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zhangye232: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-07 17:54:51

你跑的是singe stranded DNA, 还是双链DNA？你跑的电泳是变性还是非变性？
我假定是单链DNA，非变性电泳

如果你电泳条件够温和，没有大量发热的情况下，你的DNA可以形成好多种稳定的hairpin的结构（Tm> 50°C），所以出现几种结构完全可能。

如果你想确认，而且你可以做放射性实验室的话，可以跑变性胶，看是否是一条带

或如果你的条带上面有发光基团，也可以跑变性胶，看是否是一条带。

GOOD LUCK