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hzfish金虫 (正式写手)
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openmpi安装 已有1人参与
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openmpi安装 由于orca并行计算必须使用mpi环境，遂在网上http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.6/下载了openmpi-1.6.5.tar.gz。 1、安装基本要求 需要c、c++、fortran77、fortran90编译器。检查系统中是否安装了以上编译器。 shell$ which cc /usr/bin/cc shell$ which gcc /usr/local/bin/gcc shell$ which c++ /usr/local/bin/c++ shell$ which ifort /opt/intel/composer_xe_2011_sp1.8.273/bin/intel64/ifort 2、准备安装文件 把openmpi-1.6.5.tar.gz上传需要的安装的目录，并解压。 shell$ tar -xvzf openmpi-1.6.5.tar.gz 3、在使用用户名下建议安装openmpi的目录，这里用：/home/usr/mpi 在当前目录下 shell$ mkdir mpi 4、配置安装环境 进入openmpi的文件目录 shell$ ./configure --prefix=/home/usr/mpi CC=gcc CXX=c++ F77=ifort FC=ifort --prefix用来指定安装目录 CC=gcc CXX=c++ F77=ifort FC=ifort 指定编译器 5、编译安装 shell$ make all shell$ make install 以防出错，这里安装了所有包。 6、设定执行路径和数据库路径 在用户目录下的.bashrc文件中添加 export PATH=/home/teachera211/mpi/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/teachera211/mpi/lib 读取当前设置 shell$ source .bashrc 7、验证 shell$ which mpicc ~/mpi/bin/mpicc shell$ which mpic++ ~/mpi/bin/mpic++ shell$ which mpif77 ~/mpi/bin/mpif77 shell$ which mpif90 ~/mpi/bin/mpif90 8、测试 进入example目录，编译一个文件 shell$ mpicc mpicc -g hello_c.c -o hello_c shell$ ./helle_c Hello, world, I am 0 of 1 并行测试 shell$ mpirun -np 4 helle_c Hello, world, I am 1 of 4 Hello, world, I am 0 of 4 Hello, world, I am 2 of 4 Hello, world, I am 3 of 4 设置4cpu。 |
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2楼2014-04-24 09:23:37