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zgfxray

金虫 (小有名气)

[求助] 已知蛋白三维结构如何确定该蛋白功能 已有1人参与

本人对一株光合细菌中保守假定蛋白进行了结构解析,如何在此基础上确定该蛋白的功能,或者有什么办法研究该蛋白的功能?求各位帮助
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认真对待每件事
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种up-bottom的问题,没什么经验

通过蛋白序列,可以blast同源蛋白家族,然后看看同一家族蛋白都是什么功能的

如果是功能蛋白,那么看它哪一类酶,可以促使什么反应,然后找底物,验证是否有该活性。

如果是结构蛋白,这个就没太多可以展开的了。

good luck!
行至水穷处,坐看云起时
2楼2014-03-26 14:23:26
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zgfxray

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pennchem at 2014-03-26 14:23:26
这种up-bottom的问题,没什么经验

通过蛋白序列,可以blast同源蛋白家族,然后看看同一家族蛋白都是什么功能的

如果是功能蛋白,那么看它哪一类酶,可以促使什么反应,然后找底物,验证是否有该活性。

如果 ...

谢谢你,我这个蛋白是个假定蛋白,blast结果好多也都是假定蛋白,所以,我想能不能通过其他实验去研究这种蛋白的功能
认真对待每件事
3楼2014-03-31 11:52:33
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