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怎样在MS中建立这三种金属团簇，会建的高手进来！
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各位前辈，大家好： 最近在文献上看到三种Au13的团簇，分别如我下面上传的，可我不知道这个怎么在ms中构建，哪位高手会建，主要是详细讲一下建的步骤。 文献对这三种团簇的描述分别如下： 1.Particle 1L is planar and consists of 13 atoms belonging to the (111) surface (see Figure 1). 2.Particle 2L initially consisted of two layers of 4 and 9 atoms parallel to the (001)surface and with (111) side facets 3.particle 3L consists of three layers of 3, 7, and 3 atoms parallel to (111)  1.png  2.png  3.png |
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导入Au的cif，cleave111表面，建立成supercell，然后手动切除不要的原子。再copy到其他的xsd中。 我不知道你用什么程序，我就带着xsd附件上来。 |
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2014-03-26 02:02:02, 4.91 K
2楼2014-03-26 02:02:08
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这样吧，教你个懒办法，先选中上面两层，在Display style-Display style中显示方式选择为none，这样上面两层就不显示了，在第三层（显示的这层）靠中间一些选取三个相邻的（构成三角形的）原子，其他的全删掉。 之后不选择任何原子，意味着全局的设定，将Display style改成球棍，恢复了原来的显示，在选中第一层，改为显示为none，这样就只显示第二第三层。这时从底下往上看（第三层向第一层的方向），刚刚留下的构成三角形的三个原子正好和上面一层7个原子构成的六边形连在一块儿，这一层除了这7个原子，其他原子统统删除。如果出现的不是六边形，那么撤销到刚刚的步骤，改为留下与刚刚那个三角形相邻的三角形，这样第二层留下的就是个六边形。 同样，恢复到球棍模型，休整第一层，留下三个很显然的原子就可以了。 |
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小小鑫0009楼2014-03-27 01:10:31
我的这三个模型都做出来了，我现在在文献上看到Ni2到Ni13的这几个已经优化好后的模型图，现在想按照这些形状在ms里建一下它们的初始模型，我不知道该怎么下手，是用sketch atom 这个按钮搭建吗？但是这样的话，我感觉搭建出来的模型特别随意，比如说原来的几条边长都相等，现在不相等了，这样的话会影响优化结果吗？还是不用这个方法搭建，有更好的方法，在Ni的晶胞超胞模型中，用切删原子的方法行不行，还是在别的模型中删那？望前辈指导~
10楼2014-03-27 11:30:53
