| 查看: 4276 | 回复: 14 | ||||
[求助]
怎样在MS中建立这三种金属团簇，会建的高手进来！
|
||||
|
各位前辈，大家好： 最近在文献上看到三种Au13的团簇，分别如我下面上传的，可我不知道这个怎么在ms中构建，哪位高手会建，主要是详细讲一下建的步骤。 文献对这三种团簇的描述分别如下： 1.Particle 1L is planar and consists of 13 atoms belonging to the (111) surface (see Figure 1). 2.Particle 2L initially consisted of two layers of 4 and 9 atoms parallel to the (001)surface and with (111) side facets 3.particle 3L consists of three layers of 3, 7, and 3 atoms parallel to (111)  1.png  2.png  3.png |
回复此楼» 猜你喜欢
我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？
已经有3人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有18人回复
-
国自然评审意见
已经有15人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有13人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有14人回复
-
系统查不到
已经有11人回复
-
有没有仍没收到信息的
已经有3人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有8人回复
-
基金不中，共勉
已经有11人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有9人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请了解TEM观察金属蠕变拉伸材料内部位错运动的高手进来解答以下问题
已经有19人回复
- 求钛合金金相高手进来看看这是怎么回事
已经有33人回复
- 【求助】求助长柱中间带孔陶瓷成型，有经验的没经验的高手师傅同行都进来指导下
已经有10人回复
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:00:55
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:00:55
|
导入Au的cif，cleave111表面，建立成supercell，然后手动切除不要的原子。再copy到其他的xsd中。 我不知道你用什么程序，我就带着xsd附件上来。 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : cluster.rar
2014-03-26 02:02:02, 4.91 K
2楼2014-03-26 02:02:08
aaq2800
铁杆木虫 (知名作家)
- 应助: 51 (初中生)
- 金币: 28613.3
- 散金: 1522
- 红花: 29
- 沙发: 1
- 帖子: 9618
- 在线: 2190小时
- 虫号: 598401
- 注册: 2008-09-10
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
3楼2014-03-26 09:14:35
4楼2014-03-26 10:48:23
5楼2014-03-26 11:13:50
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
6楼2014-03-26 22:20:28
7楼2014-03-26 23:12:21
8楼2014-03-26 23:14:11
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:02:03
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:02:03
|
这样吧，教你个懒办法，先选中上面两层，在Display style-Display style中显示方式选择为none，这样上面两层就不显示了，在第三层（显示的这层）靠中间一些选取三个相邻的（构成三角形的）原子，其他的全删掉。 之后不选择任何原子，意味着全局的设定，将Display style改成球棍，恢复了原来的显示，在选中第一层，改为显示为none，这样就只显示第二第三层。这时从底下往上看（第三层向第一层的方向），刚刚留下的构成三角形的三个原子正好和上面一层7个原子构成的六边形连在一块儿，这一层除了这7个原子，其他原子统统删除。如果出现的不是六边形，那么撤销到刚刚的步骤，改为留下与刚刚那个三角形相邻的三角形，这样第二层留下的就是个六边形。 同样，恢复到球棍模型，休整第一层，留下三个很显然的原子就可以了。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
小小鑫0009楼2014-03-27 01:10:31
我的这三个模型都做出来了，我现在在文献上看到Ni2到Ni13的这几个已经优化好后的模型图，现在想按照这些形状在ms里建一下它们的初始模型，我不知道该怎么下手，是用sketch atom 这个按钮搭建吗？但是这样的话，我感觉搭建出来的模型特别随意，比如说原来的几条边长都相等，现在不相等了，这样的话会影响优化结果吗？还是不用这个方法搭建，有更好的方法，在Ni的晶胞超胞模型中，用切删原子的方法行不行，还是在别的模型中删那？望前辈指导~
10楼2014-03-27 11:30:53
