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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

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虫号: 2648268
注册: 2013-09-11
性别: MM
专业: 理论和计算化学

[求助] 怎样在MS中建立这三种金属团簇，会建的高手进来！

各位前辈，大家好：
最近在文献上看到三种Au13的团簇，分别如我下面上传的，可我不知道这个怎么在ms中构建，哪位高手会建，主要是详细讲一下建的步骤。
文献对这三种团簇的描述分别如下：
1.Particle 1L is planar and consists of 13 atoms belonging to the (111) surface (see Figure 1).
2.Particle 2L initially consisted of two layers of 4 and 9 atoms parallel to the (001)surface and with (111) side facets
3.particle 3L consists of three layers of 3, 7, and 3 atoms parallel to (111)

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好好研究，天天向上！

1楼2014-03-25 23:35:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

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应助: 47 (小学生)
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注册: 2011-08-16
性别: GG
专业: 金属材料的磨损与磨蚀
管辖: 第一性原理

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:02:03

引用回帖:

8楼: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-26 23:14:11
前辈，真是太谢谢你了，在你的指导下，我终于懂那么点意思了，但是第三个，我还是切不出来，我按照你的建了三层111面，但是怎么也看不出到底怎么切出那个形状，还望前辈指导～前辈，你这次应助回复，我就可以给你金 ...

这样吧，教你个懒办法，先选中上面两层，在Display style-Display style中显示方式选择为none，这样上面两层就不显示了，在第三层（显示的这层）靠中间一些选取三个相邻的（构成三角形的）原子，其他的全删掉。

之后不选择任何原子，意味着全局的设定，将Display style改成球棍，恢复了原来的显示，在选中第一层，改为显示为none，这样就只显示第二第三层。这时从底下往上看（第三层向第一层的方向），刚刚留下的构成三角形的三个原子正好和上面一层7个原子构成的六边形连在一块儿，这一层除了这7个原子，其他原子统统删除。如果出现的不是六边形，那么撤销到刚刚的步骤，改为留下与刚刚那个三角形相邻的三角形，这样第二层留下的就是个六边形。

同样，恢复到球棍模型，休整第一层，留下三个很显然的原子就可以了。