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你是我的幸福

新虫 (正式写手)

[求助] miRNA靶基因预测是用3‘UTR还是用全序列好? 已有3人参与

有没有知道预测miRNA靶基因可以用全序列吗?一般是不是都用3‘UTR呢?非常着急,期待大家回复
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你问的是一个miRNA作用方式的理论问题,而这个问题还在研究过程中,越来越多的高通量数据显示,miRNA同样可以作用于mRNA的编码区。
而所有的miRNA预测算法,都是落后于实际理论发现的,所以miRNA预测,看看而已。
3楼2014-03-25 16:16:25
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查看全部 5 个回答

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般都是用基因的3‘UTR进行预测的
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2014-03-25 16:09:28
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wpmelody

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

通常情况下都是3‘UTR的 但是RNA22这个软件可以实现编码区的预测
4楼2014-11-18 16:40:01
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残留躯壳

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wpmelody at 2014-11-18 16:40:01
通常情况下都是3‘UTR的 但是RNA22这个软件可以实现编码区的预测

请问您有相关的本地预测软件没有,我刚进行高通量测序,也有想做的候选基因,但是没有相关的本地预测软件安装包,请问您能不能发我一下(邮箱:liuhongzhu2017@outlook.com),感激不尽!
卧薪藏胆,三千越甲可吞吴
5楼2018-08-29 22:56:46
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