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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » miRNA靶基因预测是用3‘UTR还是用全序列好？
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你是我的幸福

新虫 (正式写手)

[求助] miRNA靶基因预测是用3‘UTR还是用全序列好？已有3人参与

有没有知道预测miRNA靶基因可以用全序列吗？一般是不是都用3‘UTR呢？非常着急，期待大家回复
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1楼2014-03-25 13:05:18
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般都是用基因的3‘UTR进行预测的
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2014-03-25 16:09:28
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你问的是一个miRNA作用方式的理论问题，而这个问题还在研究过程中，越来越多的高通量数据显示，miRNA同样可以作用于mRNA的编码区。
而所有的miRNA预测算法，都是落后于实际理论发现的，所以miRNA预测，看看而已。
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3楼2014-03-25 16:16:25
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wpmelody

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

通常情况下都是3‘UTR的 但是RNA22这个软件可以实现编码区的预测
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4楼2014-11-18 16:40:01
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残留躯壳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wpmelody at 2014-11-18 16:40:01
通常情况下都是3‘UTR的 但是RNA22这个软件可以实现编码区的预测

请问您有相关的本地预测软件没有，我刚进行高通量测序，也有想做的候选基因，但是没有相关的本地预测软件安装包，请问您能不能发我一下（邮箱：liuhongzhu2017@outlook.com）,感激不尽！
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卧薪藏胆，三千越甲可吞吴
5楼2018-08-29 22:56:46
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