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lixg

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 关于载体改造 已有2人参与

我要进行载体改造,将载体A中的一个片段切下来,装到载体B中。由于酶切位点不很合适,只能做如下平末端连接。拟定下列操作,请高手看看合适不?如不合适,如何改进?
1. 将载体A用AscI和SpeI酶切,乙醇沉淀,ddH2O回溶,用T4 DNA polymerase末端补平,电泳,切胶,回收纯化约目的片段。
2. 将载体B用BamHI酶切(位于多克隆位点内),乙醇沉淀,ddH2O回溶,用T4 DNA polymerase末端削平,过柱子纯化、去磷酸化。
3. 将上述1.2所得产物连接,转化。
主要请高手们参谋参谋第一步和第二步是否合适。
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lixg

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-08 21:26:53
你的第一步和第二步看起来没问题,但实际操作尤其是连接估计不好做。

非常感谢!以前没做过这样的方法,听你这么说就放心了。
4楼2014-03-09 09:58:36
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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-08 22:02:08
lixg: 金币+5, ★★★很有帮助, 嗯,按照我的方案如果做不出来,就用你的方案做一下。毕竟平端不好连。非常感谢! 2014-03-09 09:55:09
通过PCR克隆,把载体A的那个片段切下来。这个方案不行?

1、设计引物,5‘端添加所需的酶切位点和保护碱基。
2、PCR扩增(载体A为模版),产物纯化、酶切回收目的片段。
3、载体B酶切回收目的片段。
4、上述2、3的目的片段连接,转化,摇菌。
5、菌落PCR和酶切验证大小后,送测序,看是否有载体A是否有PCR导致的碱基突变。

注:9kb全基因的互补载体,我们也是引物新增酶切位点分为一段段地构建好,再连接在一起的。

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2楼2014-03-08 20:40:43
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-03-08 22:02:16
你的第一步和第二步看起来没问题,但实际操作尤其是连接估计不好做。
hehe
3楼2014-03-08 21:26:53
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ytetyio09

新虫 (正式写手)

可以试试这篇论文的方法,虽然是个小的改进,但是值得一试,而且很方便:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24613256
5楼2014-03-25 18:10:02
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