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vaie

铜虫 (初入文坛)

[求助] 模拟小分子的相互作用,用什么软件?已有1人参与

我想模拟一下两个小分子之间(无化学反应)非共价键的强度,比如氢键等,请问用什么软件可以做?具体模拟的方法和大分子模拟有区别吗?
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小丫丫———

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 无敌炉石 at 2014-03-07 17:00:51
两个小分子是多大,一般做蛋白和蛋白,蛋白和小分子的比较多,可以先对接,对接后再跑动力学,对接免费的应该有吧 我用的商用的DS对接,动力学可以用免费的NAMD,gromacs很多

你好,我做的蛋白质和小分子,跑完动力学之后应该怎么分析啊,我想分析一些重要的作用残基,但是不知道残基是什么
4楼2014-03-09 20:00:24
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