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ganggang2007金虫 (小有名气)
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[求助]
GCMC模拟,分子文件制作方法求助!!都来看一下吧!
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新手走在绝望的边缘!问题如下: Music做GCMC模拟的时候吸附剂(MOF)分子文件(.mol), 到底是用什么软件制作的哇?参照以前大神的帖子“借助于MSVisualizer,将CIF晶体文件读入MS,然后将多余原子删除后,makeP1,再导出为car格式,用origin读入后将其复制到excel中,就可以按照music的格式进行编辑。如果碰到一种元素有多种力场或者电荷,那么就在MS中将这个原子改变为其他元素,假设一个苯环中有三种C原子,那么就将它们分别改成Au、Ag和Fe,之后过程一样,在制作mol文件时将其再改回碳原子就可以了。” 一步步走下来都没有问题,但是最后在excel中制作好以后,粘贴到文本文档中,格式很乱,软件计算的时候分子文件报错。我估计就是分子文件格式不对。 求高手指点!!!!!!!!!!! |
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