24小时热门版块排行榜    

查看: 2753  |  回复: 20
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shiyiyaya

金虫 (正式写手)

[求助] 克隆失败原因:NdeI+KpnI? 已有4人参与

现有:
15K质粒pA,NdeI+KpnI双酶切之后产生11K+4K(回收11K做载体);
6.7K质粒pB,NdeI+KpnI双酶切之后产生4K+2.7K(回收4K做外源DNA);

连接回收的11K和4K。

结果失败:经多种方案鉴定,转化长出来的重组子都是质粒pB.

我已经尝试单酶切*2次、PCR扩增4K片段,重新转化质粒,挑单克隆再继续…都不行。感觉就像pB没有切干净。

请问虫友,可否遇到类似情况?NdeI+KpnI,这两个酶的活性就是低吗?

谢谢帮忙!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ifyousee

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shiyiyaya: 金币+2, ★有帮助 2014-03-06 08:15:32
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-03-06 12:38:57
既然你都切开了,那就是连接酶的问题。不知道你这个质粒的抗性如何。
此外,没图没真相啊。建议你跑一个pB没有酶切的,pB单酶切,pB双酶切的对比一下
既然出现两条带,不太可能是没切干净,感觉。
还有内切酶不行的话换个牌子的内切酶试一下。但是个人觉得你用的那个牌子的内切酶还是很强悍的。我构建过3个载体,都是用Fe***的。
有一点我很好奇,为啥你内切酶用Fe****的,连接酶用N**的。

质粒有没有切干净我个人感觉看电泳图就能说明问题。我质粒单酶切都是单一条带,没有切过的质粒都是2-3条带。

另外你说都是重组子pB,这个结论你是怎么得出来的??测序验证?PCR检验?
质粒、RNA跑电泳的话marker纯粹仅仅作为参照,并不能绝对反映出质粒或是RNA的真实大小!!
6楼2014-03-05 23:51:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

三蛰

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-05 22:48:14
shiyiyaya: 金币+2, ★有帮助 2014-03-05 23:02:49
shiyiyaya: 金币+2, ★有帮助 2014-03-06 20:28:28
酶切的话,不存在那种酶的酶活性问题,有的只是不同厂家的酶质量问题,另外存放等影响因素。当然操作时添加适当的量也是相当重要的。我觉得你说说你的酶切和连接具体操作会有助于大家对你进行分析。
我不会!
2楼2014-03-05 20:19:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-05 22:48:20
shiyiyaya: 金币+2, ★有帮助 2014-03-05 22:53:18
建议你换换新酶分别酶切,每次酶切跑个胶看看有没有切完全,转化时加一个酶切对照看看有没有菌生长,没长说明切完全,长了但比连接产物少很多表明还可以挑选出阳性菌。
hehe
3楼2014-03-05 20:54:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiyaya

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-05 20:54:57
建议你换换新酶分别酶切,每次酶切跑个胶看看有没有切完全,转化时加一个酶切对照看看有没有菌生长,没长说明切完全,长了但比连接产物少很多表明还可以挑选出阳性菌。

我试过。双酶切之后,电泳时明显切开两条带。与未酶切的质粒一起跑,条带大小明显不同,只是有一条与4K大小类似。
取4k片段直接转化,也长出来过,鉴定之后也是原来的质粒,7K左右。
我还是怀疑有一些酶切干净的质粒再里面,可是我降低质粒量,增加酶切时间等等,都不成。
未解啊!
4楼2014-03-05 22:53:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +7 Isak0320 2026-10-12 10/500 2026-10-12 22:38 by 大飞鱼鱼鱼
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +4 wangyl_123 2026-10-10 8/400 2026-10-12 18:09 by wangyl_123
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 6/300 2026-10-12 14:55 by 简单化xn
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见