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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » Amorphous Cell建模问题
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Zr891002

金虫 (小有名气)

[求助] Amorphous Cell建模问题 已有2人参与

比如一个nanocluster构建的Cu球，用AC将他与水分子混合，怎么让Cu球在盒子的中心呢？
或者怎么调整球的位置呢。！！！！！！！！！！！！

求大神们帮忙啊！
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分子模拟 Amorphous cell

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加油，一定能成功
1楼 2014-03-03 18:32:52
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-03-04 16:47:11
如果要好看的话，可以试试4L的方法移动原子

其实
如果你知道AC的意义的话，球在不在中心对模拟结果是无所谓的
AC是对宏观无规结构进行一定的周期性简化而已

在海滩画个方形估算海滩无序皮球数量
有人喜欢以红色皮球为中心画方形，有人喜欢随便画
两个估算结果之间的差异没什么意义，与实际结果的差异只是因为你画的方形小于海滩大小
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2014-03-03 23:37:37
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查看全部 6 个回答

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
对位置有特定要求的建模有点复杂，在MS AC模块的自带教程中，有一算例可供参考。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
3楼2014-03-03 20:28:22
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hanhan1020

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-04 16:46:08
Zr891002: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-05 12:49:22
将盒子中所有的原子选中，然后表头上有上下左右箭头  不断的移动就会把金属球放中间了，很容易的
赞一下(1人) 回复此楼
没有读不下的书，只有不努力的自己。
4楼2014-03-03 21:28:19
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飞利白

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2014-03-03 23:37:37
如果要好看的话，可以试试4L的方法移动原子

其实
如果你知道AC的意义的话，球在不在中心对模拟结果是无所谓的
AC是对宏观无规结构进行一定的周期性简化而已

在海滩画个方形估算海滩无序皮球数量
有人喜欢以 ...

你好，想请教下MS中如何使用Amorphous Cell建模polymer melt，我现在要建的是MPD和TMC生成的polyamide melt聚合物。Z方向周期性条件去掉，参考文献为Molecular simulations of polyamide reverse osmosis membranes。AC模块中construction和calculation—layer都试过了，可是即使成功得到初始构型了，在lammps里还是会报错，应该是初始构型建的不合理
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6楼2014-10-11 15:11:23
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