应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 关于pbs文件的说明
31/1返回列表
查看: 1727  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lifeisall

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于pbs文件的说明 已有2人参与

#PBS -l nodes=1:ppn=8,walltime=40000:00:00
#PBS -N dhfr
##PBS -m abe
#PBS -q default
#####################################
SRCDIR=$HOME/amber/evb
JOBNAME=dhfr
WORKDIR=/scratch/$USER/$PBS_JOBID

#####################################
#export g09root=/share/apps/gaussian09/A.02
#source $g09root/g09/bsd/g09.profile

# Create scratch directory on local disk
#mkdir -p $WORKDIR
# Copy input files
cd $SRCDIR
echo 'Starting mpd'
mpd &
echo 'Running script'
./Run.test
echo 'Exiting mpd'
mpdallexit
#cp $JOBNAME.com $WORKDIR
#cp $JOBNAME.chk $WORKDIR
Type  :quit<Enter>  to exit Vim         



如上 这是运行的evb.pbs文件  这个里面的每一行是什么意思   ？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-02-24 20:56:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-25 11:26:55
有#PBS的属于PBS调度系统参数
后面的都是shell语句,是可以逐一行运行的
赞一下(1人) 回复此楼
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
2楼2014-02-25 09:04:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

化学势

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-03-01 10:41:49
接楼上的：
有#PBS的属于PBS调度系统参数，比如使用节点数nodes=1，核心数ppn=8等等。
后面的都是shell语句,是可以逐一行运行的，这些命令与平时在linux环境下的含义完全一样，当然开头有#的是被注释掉的shell语句，也就是并不执行。比如#export g09root=/share/apps/gaussian09/A.02等等。
赞一下 回复此楼
3楼2014-02-28 22:28:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lifeisall 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭