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yushijiang30

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于RNAi干扰的问题 已有3人参与

我做真菌的干扰,我构建好的干扰片段:正向+intron+反向片段能不能插入到一个开放阅读框的下游,比如启动子——抗潮霉素基因——终止子,我能不能把片段插入到抗潮霉素基因——终止子 之间呢,还是只能放在启动子后面?

[ Last edited by silicare on 2014-3-3 at 08:42 ]
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意孤城_

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-30 16:22:26
我不明白一点,你要干扰的基因是真菌自身表达的还是?如果是自身表达为何又要转抗潮霉素基因?双重抑制?
表达siRNA或者shRNA的载体是个单独的,因为表达RNA的启动子一般和表达DNA的启动子是不一样的
3楼2014-02-22 15:17:34
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
插入在潮霉素基因后端好些,我们RNAi都是单独一个表达盒驱动,你这样会影响潮霉素表达。
hehe
4楼2014-02-22 19:53:10
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咆哮的白菜

金虫 (正式写手)

放在后面会不会和潮霉素一起翻译成融合蛋白啊?起不到干扰作用,放在前面会不会干扰潮霉素的翻译,不能筛选阳性转化子?感觉还是两套单独的转录系统比较靠谱吧。

[ 发自小木虫客户端 ]
姥姥不疼,舅舅不爱
10楼2014-02-24 15:43:09
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普通回帖

鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个应该在前面吧。如果放在后面的话,在未表达基因之前,RNAi片段都已经断开了。我是这么认为的,不知道是不是这样。

还有,我现在做的克隆是分别的,按你的意思就是说1.启动子——抗潮霉素基因——终止子,2.启动子——正向+intron+反向片段——终止子。是两个载体,这是做植物的。
2楼2014-02-21 15:05:38
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yushijiang30

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 意孤城_ at 2014-02-22 15:17:34
我不明白一点,你要干扰的基因是真菌自身表达的还是?如果是自身表达为何又要转抗潮霉素基因?双重抑制?
表达siRNA或者shRNA的载体是个单独的,因为表达RNA的启动子一般和表达DNA的启动子是不一样的

我做的是通过真菌介导干扰害虫,把干扰载体转入真菌,在真菌入侵昆虫的时候释放干扰片段到昆虫体内。抗潮霉素基因是用来筛选阳性真菌的,你说的RNAi干扰的启动子不一样,我的启动子是真菌的色氨酸启动子,启动500bp左右的干扰片段,这样行吗
5楼2014-02-24 10:03:34
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yushijiang30

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-02-22 19:53:10
插入在潮霉素基因后端好些,我们RNAi都是单独一个表达盒驱动,你这样会影响潮霉素表达。

我也是图省事,要是有适合的酶切位点,我打算插入到潮霉素基因下游,这样就不用重新连接启动子,终止子基因进去了,所以才问问我这样做行不行,如果不行,就只好重新构建一个表达盒了。

另问,干扰片段和超表达片段毕竟不一样,像超表达是要表达成蛋白质的,最好有单独的启动子启动,真核生物毕竟是单顺反子的,但是干扰载体不一样,他只要在转录结束后,正反片段互补形成颈环结构就行了,连在任何一个表达基因后边都不会对前边的基因表达形成阻碍,我这样理解正确吗?
6楼2014-02-24 10:13:41
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yushijiang30 at 2014-02-24 10:13:41
我也是图省事,要是有适合的酶切位点,我打算插入到潮霉素基因下游,这样就不用重新连接启动子,终止子基因进去了,所以才问问我这样做行不行,如果不行,就只好重新构建一个表达盒了。

另问,干扰片段和超表达 ...

是的
hehe
7楼2014-02-24 12:04:36
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意孤城_

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by yushijiang30 at 2014-02-24 10:03:34
我做的是通过真菌介导干扰害虫,把干扰载体转入真菌,在真菌入侵昆虫的时候释放干扰片段到昆虫体内。抗潮霉素基因是用来筛选阳性真菌的,你说的RNAi干扰的启动子不一样,我的启动子是真菌的色氨酸启动子,启动500b ...

可以的,他们两个基因具有不同的表达盒,你的抗性基因和干扰基因要在两个不同的表达盒内,是2个阅读框。一个可以完整表达抗性基因,一个完整表达干扰基因,可以在一个载体上实现
8楼2014-02-24 12:19:27
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yushijiang30

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 意孤城_ at 2014-02-24 12:19:27
可以的,他们两个基因具有不同的表达盒,你的抗性基因和干扰基因要在两个不同的表达盒内,是2个阅读框。一个可以完整表达抗性基因,一个完整表达干扰基因,可以在一个载体上实现...

好的,已经明白了。
9楼2014-02-24 15:22:49
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