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奈落之夜木虫 (正式写手)
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[求助]
【求助】lammps关于fix ave/spatial命令应用问题
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想利用fix ave/spatial的分层和求平均来做一个热传导，传导后希望能够得到每一层的温度能量来画图，如何能输出每一层的能量啊 。可有例子。用compute 1 all ke/atom 或者计算temp 添加在后面 能否输出每一层的能量和温度 [ Last edited by 奈落之夜 on 2014-2-18 at 17:50 ] |
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zhang53201
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月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-02-26 21:59:04
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-02-26 21:59:04
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多谢 我会注意原子数目的。 有几个问题请问一下， 问题1：compute设置成特定的那块层，是说要在前面设置compute的时候就设定吗，这个命令会不会自己输出特定层的。也就是说我再前面设定compute ke/atom,例如下面的例子compute ke all ke/atom compute ke all ke/atom variable temp atom c_ke/1.5/8.617343e-5 variable x atom x variable y atom y variable z atom z fix temp_profile_graphene mobile ave/spatial 1 100 1000 z lower ${delta_CNT} c_ke v_z v_temp file temp_profile_graphene_hss2.dat units reduced 定义的时候只是定义了计算每个原子的动能之类。输出的时候能不能对应于每个层输出相应层的数据. 问题2：我建的就是石墨烯 不太规则所以lattice不知道如何定义。如果用reduced应该不用设置lattice。假设在x方向分25层是不是就应该定义为fix temp_profile_graphene mobile ave/spatial 1 100 1000 x lower 0.04 c_ke v_z v_temp file temp_profile_graphene_hss2.dat units reduced。 norm这个命令用不用加上， 问题3：有解释说norm关键字影响到每Nfreq步的输出结果如何平均出来。对于all选项，层属性对所有Nrepeat个采样点的所有原子进行平均，输出值是总量和/总原子数。是不是加上norm all之后算的值才是整个层所有原子平均的温度或者能量的。 问题:4：里面的ave 说设为one为每个 输出步 都是独立的输出结果。而runing则输出步的计算还要与以前输出的计算值进行平均。这是如何与以前的计算进行平均。例如上面设置的 每1000步 把前面100步的结果进行计算。这个如果设置了ave runing或者one会有什么不同呢。 感觉是自己知识不够，看说明书，看别人的翻译看不太懂。希望能帮我解答一下 |
3楼2014-02-26 20:23:53
奈落之夜
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5楼2014-03-04 08:19:03
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