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rainyxiao

新虫 (小有名气)

[求助] 有关ONIOM出现 已有2人参与

最近要学ONIOM,所以画了个东西试试。不过却提示有错误,请看下面。

输入文件:
%nprocshared=6
%mem=7GB
%chk=test4.chk
# opt oniom(b3lyp/genecp:pm6) geom=connectivity pseudo=read

2-layer ONIOM optimization

0 2 0 2 0 2
F                0   -1.04150621    0.00000000   -2.12610949 L
F                0   -2.03368194   -1.14289207   -0.41221877 L
F                0   -2.03368194    1.14289207   -0.41221877 L
C                0   -1.29903811    0.00000000   -0.75000000 L H 5
Zn               0    0.00000000    0.00000000    0.00000000 H
O                0    0.00000000    0.00000000    1.83000000 H
O                0    1.44219210    0.00000000   -0.83265000 H
O                0    0.35328638   -1.48828530    0.27562453 H
H                0    0.90509668    0.00000000    2.15000000 H
H                0    1.30742792   -1.59241051    0.29490810 H
H                0    2.17186857    0.00000000   -0.20881328 H

1 4 1.0
2 4 1.0
3 4 1.0
4 5 1.0
5 6 1.0 7 1.5 8 1.0
6 9 1.0
7 11 1.0
8 10 1.0
9
10
11

C H O 0
6-31g(d,p)
****
Zn 0
Lanl2dz
****

Zn 0
Lanl2dz


输出:
略...................
======================================================================================================
                                       Pseudopotential Parameters
======================================================================================================
  Center     Atomic      Valence      Angular      Power
  Number     Number     Electrons     Momentum     of R      Exponent        Coefficient   SO-Coeffient
======================================================================================================
Unrecognized potential number           6 in GetPot.
Error termination via Lnk1e in /home/msi/g09a01//g09/l301.exe at Tue Jan 21 19:48:04 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
"test4.log" 287L, 15454C              



如果我把pseudo=read 去掉 ,倒可以正常进行。不知道为什么。另外,如果不做ONIOM,只是单纯做优化的,是没什么问题的。
请问各位知道这是神马毛病吗?谢谢!
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然后怎样
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hxqiuling

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bittersmile at 2014-01-22 01:14:18
genecp 已经包括读取pseudo potential了,不用pseudo=read。

你好,我最近刚开始学习oniom计算。用了上面的这个输入文件做试验,其中按照你说的方法把pseudo=read去了,但是计算仍然不能正常结束呢,试了好多修改还是不能正常,出错信息如下,麻烦你帮我看一下啊,谢谢了先:

No c atoms found in this molecule.
Error termination via Lnk1e in D:\G09W\l301.exe at Tue Mar 18 10:46:45 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 11.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
4楼2014-03-18 10:42:08
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查看全部 4 个回答

bittersmile

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
rainyxiao: 金币+4 2014-01-22 09:06:32
genecp 已经包括读取pseudo potential了,不用pseudo=read。
2楼2014-01-22 01:14:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
rainyxiao: 金币+1 2014-01-22 09:06:36
LS正解,或者你用(gen pseudo=read)
3楼2014-01-22 07:41:10
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