| 查看: 1731 | 回复: 3 | ||
rainyxiao新虫 (小有名气)
|
[求助]
有关ONIOM出现 已有2人参与
|
|
最近要学ONIOM，所以画了个东西试试。不过却提示有错误，请看下面。 输入文件： %nprocshared=6 %mem=7GB %chk=test4.chk # opt oniom(b3lyp/genecp:pm6) geom=connectivity pseudo=read 2-layer ONIOM optimization 0 2 0 2 0 2 F 0 -1.04150621 0.00000000 -2.12610949 L F 0 -2.03368194 -1.14289207 -0.41221877 L F 0 -2.03368194 1.14289207 -0.41221877 L C 0 -1.29903811 0.00000000 -0.75000000 L H 5 Zn 0 0.00000000 0.00000000 0.00000000 H O 0 0.00000000 0.00000000 1.83000000 H O 0 1.44219210 0.00000000 -0.83265000 H O 0 0.35328638 -1.48828530 0.27562453 H H 0 0.90509668 0.00000000 2.15000000 H H 0 1.30742792 -1.59241051 0.29490810 H H 0 2.17186857 0.00000000 -0.20881328 H 1 4 1.0 2 4 1.0 3 4 1.0 4 5 1.0 5 6 1.0 7 1.5 8 1.0 6 9 1.0 7 11 1.0 8 10 1.0 9 10 11 C H O 0 6-31g(d,p) **** Zn 0 Lanl2dz **** Zn 0 Lanl2dz 输出: 略................... ====================================================================================================== Pseudopotential Parameters ====================================================================================================== Center Atomic Valence Angular Power Number Number Electrons Momentum of R Exponent Coefficient SO-Coeffient ====================================================================================================== Unrecognized potential number 6 in GetPot. Error termination via Lnk1e in /home/msi/g09a01//g09/l301.exe at Tue Jan 21 19:48:04 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 1.6 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 "test4.log" 287L, 15454C 如果我把pseudo=read 去掉 ，倒可以正常进行。不知道为什么。另外，如果不做ONIOM，只是单纯做优化的，是没什么问题的。 请问各位知道这是神马毛病吗？谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
cif求助下载
已经有1人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有5人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有211人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有0人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有2人回复
-
化学化工学院 招收化工、化学、材料等相关方向研究生（学硕、专硕都有调剂名额）
已经有1人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有0人回复
-
温州大学新能源材料微观溯源课题组招收2026级博士研究生（材料、化学方向）
已经有6人回复
-
材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流
已经有5人回复
-
26申博
已经有2人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请问Al合金海水中做的EIS，低频出现感抗，这个感抗弧大小与什么有关？
已经有4人回复
- 关于高斯计算opt+freq的问题
已经有3人回复
- 求助！有关物质溶液稳定性中出现多余的峰！
已经有17人回复
- 有关锂电池文献里面出现的非活性物质问题
已经有7人回复
- 高效液相色谱检查有关物质出现的问题
已经有4人回复
- 贝叶斯公式求概率 疑问
已经有3人回复
- 有关氯化亚砜回流出现的问题
已经有33人回复
- 关于熵变的计算，有人知道怎么计算大的体系的熵变吗？比如将近一千个残基的体系？
已经有11人回复
- Error termination via Lnk1e in d:\g09\l103.exe
已经有9人回复
- 【求助】计算Si，ZnO这类半导体时，ISMEAR=-5。为何无论SIGMA取什么值，entropy均为零
已经有4人回复
- 【求助】关于BSSE校正：优化后进行BSSE校正码？
已经有6人回复
- 【求助】重金求专家解决：如何给过渡金属加半经验参数？
已经有22人回复
- 【求助】GV输出的Oniom输入文件如何修改
已经有17人回复
2楼2014-01-22 01:14:18
枪下游魂
木虫 (著名写手)
- 应助: 718 (博后)
- 金币: 8336.9
- 散金: 175
- 红花: 80
- 帖子: 1498
- 在线: 542.6小时
- 虫号: 2620258
- 注册: 2013-08-28
- 专业: 理论和计算化学
3楼2014-01-22 07:41:10
hxqiuling
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1161.3
- 散金: 40
- 帖子: 110
- 在线: 134.7小时
- 虫号: 449302
- 注册: 2007-11-02
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
|
你好，我最近刚开始学习oniom计算。用了上面的这个输入文件做试验，其中按照你说的方法把pseudo=read去了，但是计算仍然不能正常结束呢，试了好多修改还是不能正常，出错信息如下，麻烦你帮我看一下啊，谢谢了先： No c atoms found in this molecule. Error termination via Lnk1e in D:\G09W\l301.exe at Tue Mar 18 10:46:45 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 11.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
4楼2014-03-18 10:42:08
