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rainyxiao新虫 (小有名气)
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[求助]
有关ONIOM出现已有2人参与
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最近要学ONIOM，所以画了个东西试试。不过却提示有错误，请看下面。 输入文件： %nprocshared=6 %mem=7GB %chk=test4.chk # opt oniom(b3lyp/genecp:pm6) geom=connectivity pseudo=read 2-layer ONIOM optimization 0 2 0 2 0 2 F 0 -1.04150621 0.00000000 -2.12610949 L F 0 -2.03368194 -1.14289207 -0.41221877 L F 0 -2.03368194 1.14289207 -0.41221877 L C 0 -1.29903811 0.00000000 -0.75000000 L H 5 Zn 0 0.00000000 0.00000000 0.00000000 H O 0 0.00000000 0.00000000 1.83000000 H O 0 1.44219210 0.00000000 -0.83265000 H O 0 0.35328638 -1.48828530 0.27562453 H H 0 0.90509668 0.00000000 2.15000000 H H 0 1.30742792 -1.59241051 0.29490810 H H 0 2.17186857 0.00000000 -0.20881328 H 1 4 1.0 2 4 1.0 3 4 1.0 4 5 1.0 5 6 1.0 7 1.5 8 1.0 6 9 1.0 7 11 1.0 8 10 1.0 9 10 11 C H O 0 6-31g(d,p) **** Zn 0 Lanl2dz **** Zn 0 Lanl2dz 输出: 略................... ====================================================================================================== Pseudopotential Parameters ====================================================================================================== Center Atomic Valence Angular Power Number Number Electrons Momentum of R Exponent Coefficient SO-Coeffient ====================================================================================================== Unrecognized potential number 6 in GetPot. Error termination via Lnk1e in /home/msi/g09a01//g09/l301.exe at Tue Jan 21 19:48:04 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 1.6 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 "test4.log" 287L, 15454C 如果我把pseudo=read 去掉 ，倒可以正常进行。不知道为什么。另外，如果不做ONIOM，只是单纯做优化的，是没什么问题的。 请问各位知道这是神马毛病吗？谢谢！ |
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2楼2014-01-22 01:14:18
枪下游魂
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hxqiuling
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- 专业: 理论和计算化学
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你好，我最近刚开始学习oniom计算。用了上面的这个输入文件做试验，其中按照你说的方法把pseudo=read去了，但是计算仍然不能正常结束呢，试了好多修改还是不能正常，出错信息如下，麻烦你帮我看一下啊，谢谢了先： No c atoms found in this molecule. Error termination via Lnk1e in D:\G09W\l301.exe at Tue Mar 18 10:46:45 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 11.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
4楼2014-03-18 10:42:08