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steffi_fifi

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质组的题,都是关于质谱的,求解答啊!

1. 什么是正交分离方法啊?给一个2-dmensionale peptidchromatography的例子,说明优缺点。
2. 实验设计,细胞激酶抑制剂(未处理的细胞作为对照,定量蛋白质组分析的实验设计。描述了细胞培养物的步骤,以及质谱分析。
3. 有3个蛋白质鉴定的方法(质谱),是那3个?(我的答案:peptid mass fingerpriting,partial peptide sequence,ms/ms)哪一种适合复杂或者完整的蛋白?sequence tag 可以鉴定蛋白,而且是仅有3-4个已知的氨基酸,为什么呢?peptid mass fingerprinting 在鉴定碱性蛋白的时候会出现什么问题呢?
4. 串联质谱怎么出现肽片段图谱?
5. 自下而上法,为什么用trypsin作为蛋白酶? 这个和CID有联系吗?还有,自上而下和自下而上法的主要区别是什么? ( 是蛋白质先碎裂为肽片段吗?方法不同?


求高手解答啊,我做题做的头晕了,花样好多。。。。。。谢谢啦!
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steffi_fifi

新虫 (初入文坛)

求帮助。。。。。。
4楼2014-01-14 16:24:28
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steffi_fifi

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by steffi_fifi at 2014-01-13 18:15:05
顶啊顶!

求解答,求帮助!
3楼2014-01-13 20:57:18
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steffi_fifi

新虫 (初入文坛)

各位大神,快来啊!
7楼2014-01-17 18:18:52
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cpn

木虫 (正式写手)

lz,你这问题好多都没头又没尾额。。
1,恕偶没听说过正交分离方法的二维液相,但是显然lz是要问二维液相分蛋白多肽的问题http://en.wikibooks.org/wiki/Pro ... (2D)_Chromatography
2,这是要问什么问题?
3、partial peptide sequence和ms/ms这不是一个并排的关系吧?
peptide sequence tag http://en.wikipedia.org/wiki/Peptide_sequence_tag
http://doc.bio1000.com/show-5000.html
4、详见上面链接
5、Top-down,因为Trypsin酶切,对于大部分蛋白质,可以产生大小比较合适的肽段,而后肽段进行CID裂解,就对肽段实现鉴定。。
好吧。。。果然快过年了有点无聊。。。
lz有时间把自己帖子顶这么多遍,google一下不难吧~你这么懒,你老板知道么?
13楼2014-01-26 15:49:03
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