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issp-hao

银虫 (正式写手)

[求助] 请帮忙看一下lammps中是否有这个势函数? 已有2人参与

想做lipid膜的MD模拟,找了一篇文章(lammps的MD模拟)想重复出来学习,但是在lammps的manul中没找到文章中的相互作用势能,给作者写信问没给回复,请帮忙看看下面的势能函数到底是lammps中自带的,还是作者自己写代码加进去的。
下面的图片是我把文章中的势能函数截图,附件文件是我想重复学习的文章,如果相互作用势能函数是作者自己写代码,谁有自己写代码加势能函数的经验,能否提供这方面的建议,看manul中增加势能函数的介绍,由于C++语言方面不是太精通,一直找不到头绪。
十分感谢提供帮助。请帮忙看一下lammps中是否有这个势函数?
1.JPG

[ Last edited by issp-hao on 2014-1-6 at 16:42 ]
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  • 附件 1 : Sknepnek_JChemPhys_137_104905_2012.pdf
  • 2014-01-06 16:40:32, 1.05 M

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issp-hao

银虫 (正式写手)

顶一下,多谢指教
2楼2014-01-11 15:10:50
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茹此无声

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-12 09:25:27
势函数一般选用常用的,公认为较好的。当然需要自己测试,看合不合适。可以去网站下,lammps里也有势文件夹,可以找到拷出来。

[ 发自小木虫客户端 ]
人类一思考,上帝就发笑。
3楼2014-01-12 00:52:16
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

如果不懂C++的话还是先自学一点基本C++比较好,否则的话你连类,基类,派生类这些基本概念都搞不清是没法粗略看懂lammps代码结构的,比方说lammps代码中每个作用势所对应的类都是pair这个基类的派生类。

你所提到的这个作用势大概可以通过修改pair_style lj/cut/coul/debye 得到. Good luck!
4楼2014-01-12 11:03:46
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